37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0769 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
106 aa  214  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  94.34 
 
 
106 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  41.58 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  42.57 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  40.4 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  41.84 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  43.01 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  34.23 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  35.92 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  32.67 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  36.79 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  34.34 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  36.79 
 
 
1294 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 
108 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  33.68 
 
 
247 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.5 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  32.65 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  36.17 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  28.43 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  28.71 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 
97 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  32.38 
 
 
117 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  41.1 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  40.98 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  29.9 
 
 
105 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 
104 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>