More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0753 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  91.23 
 
 		 592 aa  1024    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  60.26 
 
 		 567 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  100 
 
 		 604 aa  1190    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  53.2 
 
 		 561 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  35.11 
 
 		 535 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  59.68 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  44.87 
 
 		 532 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  38.85 
 
 		 332 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  56.41 
 
 		 394 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  21.79 
 
 		 597 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  24.88 
 
 		 591 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  24.4 
 
 		 581 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  23.47 
 
 		 570 aa  92  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  22.32 
 
 		 600 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  31.96 
 
 		 398 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  31.94 
 
 		 395 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  31.55 
 
 		 270 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  26.74 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  30.95 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  27.98 
 
 		 273 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  29.59 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  27.22 
 
 		 570 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1259  general secretion pathway protein E  34.21 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1347  General secretory system II protein E domain protein  32.89 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1246  General secretory system II protein E domain protein  32.89 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  25.15 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  28.99 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  29.52 
 
 		 424 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  27.71 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  27.11 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0270  General secretory system II protein E domain protein  29.33 
 
 		 841 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.126795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  33.09 
 
 		 1177 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  29.03 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  30 
 
 		 239 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 768 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  28.46 
 
 		 370 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.91 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  26.51 
 
 		 424 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.91 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2034  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 449 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792682  normal  0.101595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 473 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  35.11 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0259  General secretory system II protein E domain protein  28.95 
 
 		 841 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0249  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.79 
 
 		 834 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 151 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 647 aa  53.9  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.69 
 
 		 462 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  27.38 
 
 		 667 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  27.38 
 
 		 667 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  39.18 
 
 		 230 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  27.33 
 
 		 898 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 153 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 230 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2539  response regulator  32.09 
 
 		 658 aa  52.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 230 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.91 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.91 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  35.23 
 
 		 237 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 214 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 798 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1385 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 901 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 685 aa  51.2  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 470 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 458 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 974 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  28.26 
 
 		 234 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 657 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  35.16 
 
 		 468 aa  50.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 237 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1891  response regulator  27.86 
 
 		 379 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 357 aa  50.4  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 675 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1330  response regulator receiver  34.43 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 728 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 245 aa  50.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 803 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  30.37 
 
 		 792 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 		 551 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2401  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 449 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 357 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 785 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  39.77 
 
 		 230 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 229 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 		 664 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.07 
 
 		 1960 aa  49.3  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2281  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 128 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.498531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 657 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2984  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.31 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.826768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 705 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 		 925 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  35.23 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  28.76 
 
 		 373 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 487 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1691 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 569 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>