114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0737 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  100 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  92.33 
 
 		 299 aa  520  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  84.18 
 
 		 303 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  41.84 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.07 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  44.01 
 
 		 640 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  42.2 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.84 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  42.76 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  45.76 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.84 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  43.66 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  43.64 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  39.36 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  39.08 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 312 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  41.4 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 313 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 365 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  42.4 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  41.05 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  40 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  38.65 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.18 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.76 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  38.97 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  38.28 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  33.57 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  33.22 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.23 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  38.6 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  38.3 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.97 
 
 		 584 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.13 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  50 
 
 		 120 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  26.82 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.4 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  27.38 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5596  monosaccharide-transporting ATPase  27.53 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  25.17 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  27.94 
 
 		 347 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  27.94 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 345 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 345 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  25.89 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  27.14 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  30.81 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.45 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  25.47 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0575  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  25.35 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.607461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  23.53 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>