More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0658 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  98.48 
 
 		 66 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  89.23 
 
 		 66 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  86.15 
 
 		 66 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  83.08 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  84.62 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  81.54 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  81.54 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  81.54 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 		 66 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 		 66 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.46 
 
 		 66 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  76.92 
 
 		 66 aa  105  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0778  cold shock proteins  76.92 
 
 		 66 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 66 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  80 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 66 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 66 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.95 
 
 		 66 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0237  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 		 66 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692047  hitchhiker  0.0000000000000296416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  70.77 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 		 68 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.46 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0207  cold-shock domain-contain protein  72.31 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000092661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  80 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3009  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000338094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  70.77 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 68 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000494956  unclonable  0.00000584596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 67 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  65.08 
 
 		 69 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  68.18 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.7 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  71.43 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  71.43 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 66 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 65 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  71.43 
 
 		 65 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  71.43 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  71.43 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  71.43 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  71.43 
 
 		 65 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  71.43 
 
 		 65 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  71.43 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.861564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.08 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  69.23 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.49 
 
 		 66 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 66 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  67.69 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 68 aa  91.3  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 		 65 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 66 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 66 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 66 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  67.74 
 
 		 65 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  67.74 
 
 		 65 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 66 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 68 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 68 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>