More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0404 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  97.25 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  87.16 
 
 		 109 aa  197  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  81.65 
 
 		 109 aa  190  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  79.82 
 
 		 109 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  77.06 
 
 		 109 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  66.06 
 
 		 109 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3380  thioredoxin  75.23 
 
 		 109 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000757275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  57.94 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  57.94 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  62.04 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  59.81 
 
 		 108 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  55.96 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  58.88 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  57.28 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  55.14 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  53.21 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  57.01 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  58.65 
 
 		 106 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  58.82 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  56.07 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  56.86 
 
 		 107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  57.43 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  51.38 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  58.33 
 
 		 106 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  54.21 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  54.72 
 
 		 109 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  54.13 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  55.24 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  55.05 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  51.38 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  52.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  54 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  54.46 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  51.4 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  55.14 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  52.34 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  55.05 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  53.27 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  55.34 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  52.34 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  52.29 
 
 		 110 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  129  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  53 
 
 		 107 aa  129  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  54 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  51.38 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  51.38 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  54.13 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  55.05 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  52.29 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  54.37 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  56.57 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  52.34 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  54.13 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  54.13 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  52.34 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  52.29 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.38 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  52.34 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>