34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0363 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 278 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  84.75 
 
 		 277 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  59.72 
 
 		 683 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  55.26 
 
 		 656 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  45.74 
 
 		 692 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  46.07 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  43.96 
 
 		 2998 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  41.67 
 
 		 1067 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  38.53 
 
 		 782 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  46.88 
 
 		 1879 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  43.01 
 
 		 1199 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  33.56 
 
 		 744 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  39.1 
 
 		 2192 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  38.54 
 
 		 9585 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  39.45 
 
 		 869 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  38.89 
 
 		 1847 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.38 
 
 		 834 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1994 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  34.78 
 
 		 864 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  38.14 
 
 		 918 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1139 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  40.48 
 
 		 1550 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  40.37 
 
 		 460 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  44.21 
 
 		 2042 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  38.3 
 
 		 1401 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  36.96 
 
 		 631 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  33.61 
 
 		 739 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  34.78 
 
 		 1401 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  36.67 
 
 		 725 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 739 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  38.05 
 
 		 3802 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  27.74 
 
 		 2040 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  38.83 
 
 		 1462 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  38.68 
 
 		 1307 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>