83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0296 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  69.33 
 
 		 152 aa  226  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  86.84 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  86.18 
 
 		 152 aa  216  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  51.35 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  51.02 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  47.95 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  50.34 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  44.83 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  45.14 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  42.36 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  41.1 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  43.57 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  44.83 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  41.78 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  39.35 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  39.35 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  29.79 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  36.99 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.28 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.28 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  29.66 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.9 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.28 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  25.68 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  28.47 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.9 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.45 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  31.68 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  27.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.81 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  30.99 
 
 		 489 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  26.35 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.67 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  29.13 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  26.57 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  29.8 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  27.27 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25.83 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  27.27 
 
 		 459 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  25.95 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  26.71 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  26.03 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  27.66 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  23.61 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  26.17 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  29.68 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  26.43 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  35.24 
 
 		 433 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  28.39 
 
 		 439 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  30.34 
 
 		 496 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  24.06 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  29.66 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  26.71 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  26.71 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  26.71 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  22.22 
 
 		 151 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  22.22 
 
 		 151 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  28.87 
 
 		 133 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  25.61 
 
 		 437 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  22.96 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  22.22 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  21.05 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  22.22 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  22.22 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  22.22 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  28.65 
 
 		 429 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  26.57 
 
 		 460 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  30.07 
 
 		 488 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  24.11 
 
 		 137 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>