More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0194 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  203  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  97.12 
 
 		 104 aa  197  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  80.77 
 
 		 104 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  80.77 
 
 		 104 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  79.81 
 
 		 104 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  70.19 
 
 		 104 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  77.88 
 
 		 104 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  77.88 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  61.54 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  61.39 
 
 		 102 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  59 
 
 		 102 aa  120  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  56.73 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  55.88 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  58.51 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  56.86 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  56.44 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  52.53 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  54.46 
 
 		 115 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  54 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  54 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  51.46 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  52 
 
 		 100 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  53.54 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  55 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  54 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  53.06 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  51 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  47.96 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  49.49 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  56.84 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  45.1 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  48.51 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  45.1 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  53.4 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  58.54 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  46.08 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  61.46 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  52.81 
 
 		 99 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  47.47 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  56.1 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  48.84 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  56.1 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  54.88 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  54.88 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  54.88 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  54.88 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  54.88 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  54.88 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  54.88 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  57.32 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  43.88 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2768  hypothetical protein  48.57 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  47.87 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  44.12 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  54.12 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  46 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  42.27 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  54.22 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  40.62 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40.62 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.59 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  42.59 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  51.81 
 
 		 105 aa  76.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  42.59 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  51.81 
 
 		 105 aa  76.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  42.45 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  40.59 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  41.67 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  42.45 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  38.38 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  42.45 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  43.96 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  37.11 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  47.44 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  37.86 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  39.22 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  41.76 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  41.41 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  37.86 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  38.14 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  39.8 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  39.18 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>