15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0181 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0181  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000193703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0198  hypothetical protein  98.08 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  53.18 
 
 		 276 aa  281  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  40.23 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  36.98 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  35.34 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  38.75 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000144784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  25.75 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.03 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  35.29 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  28.92 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  28.24 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  33.77 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>