186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0177 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
239 aa  493  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  94.98 
 
 
239 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  52.57 
 
 
213 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  52.23 
 
 
210 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  58.09 
 
 
168 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  55.88 
 
 
179 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  55.47 
 
 
168 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  51.7 
 
 
168 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  50.72 
 
 
153 aa  154  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  48.74 
 
 
146 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  49.61 
 
 
149 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  48.84 
 
 
152 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  48.84 
 
 
161 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  48.84 
 
 
152 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  48.84 
 
 
161 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  48.84 
 
 
161 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  48.84 
 
 
152 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 
404 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  48.84 
 
 
216 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 
599 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
407 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 
404 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 
408 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  43.36 
 
 
408 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  48.09 
 
 
149 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  48.09 
 
 
159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 
438 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  47.66 
 
 
161 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  45.65 
 
 
149 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  47.66 
 
 
164 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  47.66 
 
 
164 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  43.15 
 
 
148 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 
147 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  41.73 
 
 
140 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  45.24 
 
 
148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  44.36 
 
 
148 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  43.41 
 
 
170 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  41.54 
 
 
141 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  39.1 
 
 
140 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 
183 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  40.8 
 
 
226 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  43.17 
 
 
145 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 
183 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  42.64 
 
 
164 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  43.57 
 
 
155 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 
158 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 
158 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 
155 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  40 
 
 
232 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  40.17 
 
 
187 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  40.17 
 
 
187 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  40.17 
 
 
187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  42.98 
 
 
155 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  40.17 
 
 
187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  40.17 
 
 
187 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  40.17 
 
 
187 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 
161 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 
178 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  40.17 
 
 
182 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 
145 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  36.89 
 
 
145 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  46.28 
 
 
166 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 
157 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  40.82 
 
 
182 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  42.97 
 
 
161 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  43.22 
 
 
157 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
183 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  40.15 
 
 
160 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  35.76 
 
 
175 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  39.39 
 
 
160 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  39.39 
 
 
160 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  39.39 
 
 
160 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  39.39 
 
 
160 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.13 
 
 
168 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0049  pilT protein, putative  34.69 
 
 
150 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0042  pilT protein  34.19 
 
 
163 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  33.12 
 
 
167 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  36.23 
 
 
152 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03391  Hpa2  43.81 
 
 
108 aa  82  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  33.83 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  30.95 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4280  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 
157 aa  72  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227858  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  30.88 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  34.62 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0253  Lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0882  lytic transglycosylase, catalytic  29.27 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0060  hypothetical protein  35.94 
 
 
187 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00816784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1529  Lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 
137 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.425819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0860  lytic transglycosylase catalytic  33.63 
 
 
124 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720569  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  28.38 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4262  lytic transglycosylase, catalytic  30.83 
 
 
162 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>