More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0158 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  74.22 
 
 		 423 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 421 aa  860    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  75.18 
 
 		 422 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  96.67 
 
 		 421 aa  840    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  73.4 
 
 		 433 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  57.04 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.15 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.19 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.38 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  53 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.35 
 
 		 454 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  51.32 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1955  NADH dehydrogenase (quinone)  55.53 
 
 		 421 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0948172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  51.32 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  50.6 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  50.6 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  49.76 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  50.6 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  49.88 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  49.88 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  49.64 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  49.64 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  49.64 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  49.64 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  49.64 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  50.12 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 		 537 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  49.03 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  48.79 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  54.21 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.28 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  50.6 
 
 		 449 aa  391  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.41 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  48.44 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.04 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  48.43 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  50.72 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  48.19 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  48.19 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  48.19 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.9 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  48.43 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  47.95 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  47.71 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  48.3 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.19 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.84 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  46.78 
 
 		 602 aa  371  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.57 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.57 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.73 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  46.9 
 
 		 545 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.23 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.91 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  46.9 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.28 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.59 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.57 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.58 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.39 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.95 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.39 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.38 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  47.28 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0991  NADH dehydrogenase (quinone)  46.27 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.13 
 
 		 451 aa  364  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.57 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.81 
 
 		 431 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.81 
 
 		 431 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.57 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.57 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  45.57 
 
 		 436 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.32 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.32 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.32 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.04 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.37 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.72 
 
 		 434 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  44.34 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.79 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  44.74 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.07 
 
 		 436 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  44.34 
 
 		 422 aa  360  4e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  43.84 
 
 		 610 aa  359  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  44.83 
 
 		 431 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.03 
 
 		 444 aa  358  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  44.83 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  45.34 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.83 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.31 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  46.7 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.07 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>