More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0145 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
102 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  99.02 
 
 
102 aa  198  2e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.33925e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  93.14 
 
 
102 aa  190  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  83.33 
 
 
102 aa  172  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  1.56169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  154  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  83.33 
 
 
102 aa  153  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  72.55 
 
 
102 aa  151  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 
102 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  55.45 
 
 
102 aa  119  2e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  55.34 
 
 
104 aa  110  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.6 
 
 
223 aa  110  8e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
124 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  110  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  109  1e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  109  1e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
105 aa  109  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
105 aa  108  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 
101 aa  108  4e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
129 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
142 aa  107  7e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 
102 aa  107  8e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
188 aa  107  8e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
104 aa  106  9e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  5.8928e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.41425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.04874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
104 aa  105  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.21763e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.08547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
103 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.92007e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.15855e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
157 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
104 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
104 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  103  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.81834e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  51.92 
 
 
104 aa  103  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.4347e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
104 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
115 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.49 
 
 
198 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
104 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  1.69225e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
115 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  1.96723e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.76317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  51.96 
 
 
104 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 
103 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.46 
 
 
221 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  50.5 
 
 
101 aa  98.6  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.09209e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
132 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
156 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.1212e-14  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.56676e-07  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  2.30006e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  43.14 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  51.46 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.54 
 
 
258 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  95.9  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.09341e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  49.5 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>