More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0117 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  44.08 
 
 		 1106 aa  896    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  51.5 
 
 		 1105 aa  1165    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  53.62 
 
 		 1111 aa  1238    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  44.08 
 
 		 1106 aa  899    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  43.26 
 
 		 1164 aa  916    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  44.64 
 
 		 1137 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  43.89 
 
 		 1160 aa  906    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  44.82 
 
 		 1137 aa  918    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  45.72 
 
 		 1136 aa  933    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  46.28 
 
 		 1142 aa  971    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  43.82 
 
 		 1131 aa  899    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  47.78 
 
 		 1088 aa  985    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  42.76 
 
 		 1108 aa  899    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  44.73 
 
 		 1106 aa  906    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  58.5 
 
 		 572 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  47.78 
 
 		 1088 aa  985    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  47.64 
 
 		 1088 aa  994    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  43.9 
 
 		 1105 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  61.58 
 
 		 548 aa  700    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  43.73 
 
 		 1131 aa  897    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  43.05 
 
 		 1108 aa  901    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  57.82 
 
 		 606 aa  665    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  44.66 
 
 		 1121 aa  926    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  42.82 
 
 		 1095 aa  895    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  44.91 
 
 		 1094 aa  931    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  47.86 
 
 		 1104 aa  1025    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  43.89 
 
 		 1113 aa  927    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  52.43 
 
 		 1119 aa  1188    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  48.55 
 
 		 1102 aa  1002    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  44.45 
 
 		 1138 aa  901    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  52.12 
 
 		 1100 aa  1173    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  46.42 
 
 		 1109 aa  969    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  52.32 
 
 		 1098 aa  1185    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  44.55 
 
 		 1093 aa  903    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  54.44 
 
 		 1112 aa  1234    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  50.05 
 
 		 1110 aa  1107    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  44.81 
 
 		 1094 aa  936    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  42.18 
 
 		 1098 aa  754    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  52.09 
 
 		 1105 aa  1187    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  41.62 
 
 		 1100 aa  891    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  60.55 
 
 		 553 aa  722    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  47.35 
 
 		 1100 aa  1005    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  43.82 
 
 		 1131 aa  899    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  61.41 
 
 		 572 aa  722    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  44.64 
 
 		 1152 aa  929    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  58.58 
 
 		 574 aa  662    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  48.33 
 
 		 1102 aa  997    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  45.28 
 
 		 1100 aa  943    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  57.22 
 
 		 596 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  46.57 
 
 		 1112 aa  998    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  50.41 
 
 		 1130 aa  1120    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  45.26 
 
 		 1099 aa  933    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  44.46 
 
 		 1101 aa  906    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  42.52 
 
 		 1134 aa  884    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  44.5 
 
 		 1154 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  44.1 
 
 		 1100 aa  871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  57.25 
 
 		 551 aa  676    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  44.63 
 
 		 1100 aa  937    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  43.82 
 
 		 1131 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  44.83 
 
 		 1088 aa  945    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  48.06 
 
 		 1092 aa  1000    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  43.26 
 
 		 1164 aa  916    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  51.9 
 
 		 1108 aa  1130    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  50.36 
 
 		 1123 aa  1115    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  54.4 
 
 		 1109 aa  1201    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  44.09 
 
 		 1093 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  61.6 
 
 		 572 aa  726    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  44.72 
 
 		 1137 aa  917    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  44.26 
 
 		 1108 aa  902    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  57.22 
 
 		 596 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  49.02 
 
 		 1121 aa  1068    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  52.89 
 
 		 1098 aa  1195    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  47.27 
 
 		 1115 aa  999    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  43.21 
 
 		 1085 aa  878    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  55.99 
 
 		 1108 aa  1238    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  52.73 
 
 		 1099 aa  1169    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  49.78 
 
 		 1113 aa  1158    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  45.33 
 
 		 1100 aa  930    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  97.4 
 
 		 1116 aa  2263    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  44.65 
 
 		 1100 aa  936    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  44.63 
 
 		 1137 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  44.55 
 
 		 1100 aa  875    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  44.39 
 
 		 1061 aa  878    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  47.24 
 
 		 1088 aa  1009    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  43.82 
 
 		 1131 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  44.49 
 
 		 1110 aa  922    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  45.04 
 
 		 1154 aa  936    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  47.37 
 
 		 1088 aa  1015    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  55.89 
 
 		 604 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  100 
 
 		 1116 aa  2311    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  61.6 
 
 		 553 aa  726    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  44.72 
 
 		 1137 aa  917    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  43.94 
 
 		 1131 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  59.18 
 
 		 556 aa  675    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  52.57 
 
 		 1121 aa  1214    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  53.1 
 
 		 1098 aa  1184    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  58.54 
 
 		 571 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  44.03 
 
 		 1101 aa  924    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  43.97 
 
 		 1100 aa  913    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  57.22 
 
 		 596 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>