54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0097 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.63376e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  91.57 
 
 
166 aa  306  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  27.16 
 
 
151 aa  67.8  6e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  26.83 
 
 
151 aa  58.5  4e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  30.1 
 
 
499 aa  58.2  6e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  33.02 
 
 
214 aa  57.8  7e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0292  hypothetical protein  26.97 
 
 
204 aa  57.4  8e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0554303  hitchhiker  0.00107443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  31.19 
 
 
207 aa  56.2  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  37.84 
 
 
143 aa  56.2  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  31.19 
 
 
203 aa  55.5  3e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  24.81 
 
 
200 aa  52  3e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  30.88 
 
 
209 aa  52.4  3e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  26.45 
 
 
702 aa  51.6  4e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  26.45 
 
 
702 aa  51.6  4e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  29 
 
 
394 aa  50.4  1e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  28.28 
 
 
156 aa  50.1  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  30.43 
 
 
101 aa  50.4  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  28 
 
 
394 aa  48.5  4e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  27.96 
 
 
213 aa  48.1  5e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  28 
 
 
394 aa  48.1  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  28 
 
 
394 aa  48.1  5e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  34.52 
 
 
647 aa  47.8  6e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  33.07 
 
 
200 aa  48.1  6e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  28.97 
 
 
177 aa  47.8  8e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  34.52 
 
 
647 aa  47.4  9e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  30.95 
 
 
220 aa  47  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  31.48 
 
 
254 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  2.07523e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
636 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  31.33 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  38.33 
 
 
393 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  30.21 
 
 
645 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  31.43 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  38.33 
 
 
393 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  27.21 
 
 
632 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  52.78 
 
 
631 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  51.28 
 
 
629 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  26.87 
 
 
194 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  37.29 
 
 
388 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  30.59 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  24 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  24.82 
 
 
632 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  29.06 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  35.48 
 
 
644 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  27.62 
 
 
231 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  29.91 
 
 
254 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  27 
 
 
546 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  36.84 
 
 
398 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  26.15 
 
 
643 aa  41.6  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  22 
 
 
395 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  28.21 
 
 
175 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  24.48 
 
 
304 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  26.4 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  27.91 
 
 
248 aa  40.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>