More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0095 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0095  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
735 aa  1448  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15428e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  91.56 
 
 
735 aa  1227  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0711  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
712 aa  405  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  36.38 
 
 
807 aa  360  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 
809 aa  358  2e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 
743 aa  353  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  35.55 
 
 
815 aa  351  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.16614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
807 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  33.23 
 
 
743 aa  349  9e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
797 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 
836 aa  346  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  34.21 
 
 
798 aa  346  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  35.13 
 
 
815 aa  344  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  36.04 
 
 
814 aa  344  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  35.58 
 
 
838 aa  343  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  37.68 
 
 
804 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  38.06 
 
 
755 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
817 aa  341  3e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
817 aa  341  3e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1623  heavy metal translocating P-type ATPase  30.51 
 
 
676 aa  340  4e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  35.06 
 
 
819 aa  340  4e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  37.98 
 
 
807 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  37.16 
 
 
831 aa  340  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  36.12 
 
 
846 aa  340  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  36.68 
 
 
806 aa  340  6e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  34.08 
 
 
846 aa  338  2e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
823 aa  338  2e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
808 aa  338  2e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
724 aa  338  3e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
787 aa  338  3e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
790 aa  337  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  37.82 
 
 
868 aa  337  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.05467e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  39.1 
 
 
806 aa  337  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 
795 aa  336  8e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
852 aa  336  8e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.44 
 
 
855 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  37.42 
 
 
755 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  38.77 
 
 
809 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  37.19 
 
 
792 aa  335  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 
905 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
807 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 
806 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
796 aa  335  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
868 aa  335  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  35.23 
 
 
826 aa  335  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  38.14 
 
 
895 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  39.79 
 
 
834 aa  334  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  39.1 
 
 
837 aa  333  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
815 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
815 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  36.38 
 
 
788 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  36.33 
 
 
801 aa  332  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  35.08 
 
 
798 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  35.08 
 
 
798 aa  332  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  37.09 
 
 
804 aa  331  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
836 aa  331  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  36.72 
 
 
936 aa  331  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  33.53 
 
 
786 aa  331  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
836 aa  331  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
833 aa  331  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  37.5 
 
 
792 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  36.43 
 
 
815 aa  330  5e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 
846 aa  330  5e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 
799 aa  330  5e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  33.23 
 
 
813 aa  330  5e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
836 aa  330  6e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.38 
 
 
841 aa  330  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
799 aa  330  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  35.51 
 
 
838 aa  330  9e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  37.09 
 
 
794 aa  329  9e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
827 aa  328  1e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  38.39 
 
 
724 aa  329  1e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  32.32 
 
 
828 aa  329  1e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  36.79 
 
 
800 aa  329  1e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.35513e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
757 aa  328  2e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  37.09 
 
 
840 aa  328  2e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  37.24 
 
 
799 aa  328  2e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
732 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.28 
 
 
772 aa  327  4e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  35.41 
 
 
831 aa  327  4e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  34.79 
 
 
814 aa  327  4e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  34.44 
 
 
805 aa  327  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  37.13 
 
 
792 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.41 
 
 
794 aa  326  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
790 aa  326  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  38.26 
 
 
786 aa  326  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  38.51 
 
 
827 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
836 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  37.12 
 
 
773 aa  326  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  37.24 
 
 
841 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
765 aa  325  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  37.19 
 
 
813 aa  325  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
793 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
729 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  35.18 
 
 
645 aa  325  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.45431e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  37.34 
 
 
804 aa  325  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  37.67 
 
 
824 aa  325  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
1020 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 
835 aa  324  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  35.32 
 
 
737 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>