127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0087 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  100 
 
 
272 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  96.32 
 
 
272 aa  504  1e-142  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  94.85 
 
 
272 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  94.12 
 
 
272 aa  493  1e-138  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  85.66 
 
 
272 aa  458  1e-128  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  86.03 
 
 
272 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  57.97 
 
 
275 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  58.7 
 
 
275 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  56.9 
 
 
300 aa  283  3e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  40.7 
 
 
289 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  42.15 
 
 
375 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  40.8 
 
 
547 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  40.18 
 
 
393 aa  134  1e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  44.69 
 
 
620 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  37.31 
 
 
420 aa  121  1e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  39.9 
 
 
405 aa  119  5e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  43.86 
 
 
630 aa  118  1e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  41.62 
 
 
399 aa  117  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  43.18 
 
 
693 aa  117  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  40 
 
 
399 aa  116  4e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  42.05 
 
 
692 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  41.92 
 
 
737 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  41.57 
 
 
886 aa  115  9e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  59.22 
 
 
572 aa  114  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  41.62 
 
 
399 aa  114  2e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  38.86 
 
 
405 aa  114  2e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  39.88 
 
 
886 aa  114  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  40.72 
 
 
753 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  38.86 
 
 
405 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  37.82 
 
 
405 aa  113  4e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  39.76 
 
 
516 aa  113  4e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  40.72 
 
 
537 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  38.34 
 
 
405 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  40.12 
 
 
762 aa  112  7e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  40.36 
 
 
514 aa  112  8e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  56.31 
 
 
578 aa  110  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  41.9 
 
 
746 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  42.16 
 
 
400 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  41.57 
 
 
1562 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  38.32 
 
 
536 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  39.52 
 
 
523 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  38.92 
 
 
892 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  38.55 
 
 
522 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  40.12 
 
 
528 aa  108  7e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  38.38 
 
 
397 aa  108  7e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  38.32 
 
 
888 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  38.32 
 
 
888 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  39.55 
 
 
432 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  31.39 
 
 
260 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  38.92 
 
 
523 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  54 
 
 
735 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  28.16 
 
 
273 aa  82  1e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  27.76 
 
 
282 aa  81.6  1e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  26.07 
 
 
281 aa  79.7  5e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  29.18 
 
 
273 aa  78.2  2e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  29.2 
 
 
272 aa  71.6  1e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  28.46 
 
 
273 aa  68.9  8e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  25.69 
 
 
277 aa  68.6  1e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  25.46 
 
 
275 aa  65.9  7e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  25.98 
 
 
292 aa  63.5  3e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  24.91 
 
 
277 aa  62.4  8e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  26.06 
 
 
274 aa  61.2  2e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  27.14 
 
 
271 aa  59.7  5e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.44656e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  24.62 
 
 
279 aa  58.5  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  23.75 
 
 
281 aa  58.2  2e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  25.43 
 
 
282 aa  58.2  2e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  23.93 
 
 
303 aa  55.8  8e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  27.54 
 
 
292 aa  55.5  9e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  26.16 
 
 
289 aa  55.5  9e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  26.23 
 
 
327 aa  55.1  1e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  22.76 
 
 
302 aa  55.1  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  25.68 
 
 
328 aa  55.5  1e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  24.73 
 
 
302 aa  54.3  2e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  25 
 
 
302 aa  54.3  2e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  22.15 
 
 
321 aa  54.7  2e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  23.1 
 
 
301 aa  53.9  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  22.73 
 
 
320 aa  53.5  4e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  23.57 
 
 
303 aa  53.1  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  23.57 
 
 
266 aa  52.8  5e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  22.4 
 
 
320 aa  52.8  5e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  23.37 
 
 
302 aa  52.8  6e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  27.17 
 
 
281 aa  52.8  7e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  27.17 
 
 
281 aa  52.8  7e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  25.1 
 
 
263 aa  52.4  7e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  26.19 
 
 
271 aa  52.4  8e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  22.4 
 
 
320 aa  52  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  23.28 
 
 
320 aa  52  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  25.45 
 
 
287 aa  51.2  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  25.45 
 
 
287 aa  51.2  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.67264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  23.37 
 
 
301 aa  50.4  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  23.76 
 
 
293 aa  50.4  3e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  26.17 
 
 
275 aa  50.1  3e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  27.31 
 
 
314 aa  50.1  4e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  25.28 
 
 
276 aa  49.7  5e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  22.39 
 
 
263 aa  48.9  8e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  24.44 
 
 
263 aa  48.9  9e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0992  flagellin domain protein  25.93 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  35.38 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  24.15 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  27.66 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>