26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0086 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  100 
 
 
241 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  96.27 
 
 
241 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  75.86 
 
 
243 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.00661e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  72.29 
 
 
243 aa  350  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  71.43 
 
 
243 aa  345  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  47.86 
 
 
222 aa  205  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  47.79 
 
 
218 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  45.37 
 
 
226 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  42.31 
 
 
219 aa  188  6e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  43.78 
 
 
226 aa  184  1e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  43.35 
 
 
218 aa  184  1e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  40.85 
 
 
226 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  44.25 
 
 
221 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  45.75 
 
 
209 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  43 
 
 
209 aa  165  7e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  43.4 
 
 
209 aa  162  4e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  39.01 
 
 
225 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  41.41 
 
 
225 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  46.51 
 
 
191 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  48.95 
 
 
196 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  48.59 
 
 
199 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  37.31 
 
 
223 aa  130  1e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  35.52 
 
 
200 aa  114  1e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.86783e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  39.72 
 
 
167 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29187e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  33.7 
 
 
177 aa  84.3  2e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>