115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0077 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  100 
 
 
616 aa  1281  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  73.85 
 
 
618 aa  938  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.14934e-09  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  76.02 
 
 
618 aa  1008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.48778e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  96.27 
 
 
616 aa  1230  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.09926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  59.77 
 
 
615 aa  796  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  74.59 
 
 
619 aa  979  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  36.29 
 
 
729 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  37.35 
 
 
670 aa  373  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  39.49 
 
 
689 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  35.93 
 
 
688 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  37.46 
 
 
688 aa  361  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  34.07 
 
 
662 aa  354  3e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  33.78 
 
 
655 aa  326  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  30.28 
 
 
757 aa  218  3e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  28.72 
 
 
658 aa  214  4e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  29.98 
 
 
566 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  30.15 
 
 
566 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  29.35 
 
 
571 aa  199  1e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  28.04 
 
 
577 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  34.06 
 
 
236 aa  137  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  30.51 
 
 
346 aa  131  4e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  29.59 
 
 
346 aa  119  1e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  29.59 
 
 
346 aa  120  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  29.38 
 
 
346 aa  119  2e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  32.16 
 
 
247 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  29.29 
 
 
241 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  29.29 
 
 
241 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  29.29 
 
 
241 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  31.07 
 
 
211 aa  80.9  7e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  28.99 
 
 
350 aa  63.5  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  7.03284e-06  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  28.38 
 
 
359 aa  62.8  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.24131e-10 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  28.38 
 
 
359 aa  61.6  4e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  28.31 
 
 
315 aa  57.8  6e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.78 
 
 
189 aa  55.1  3e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.78 
 
 
189 aa  55.1  3e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  29.66 
 
 
349 aa  54.7  5e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.7 
 
 
471 aa  53.9  9e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  8.52444e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.22 
 
 
884 aa  53.1  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  27.22 
 
 
321 aa  52.4  3e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  25.29 
 
 
372 aa  51.6  4e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  28.95 
 
 
333 aa  51.2  5e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  24.14 
 
 
2499 aa  51.2  5e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  23.68 
 
 
188 aa  51.2  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  26.27 
 
 
304 aa  51.2  6e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.73 
 
 
312 aa  51.2  6e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  24.91 
 
 
333 aa  50.8  7e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  4.22231e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  24.01 
 
 
329 aa  50.8  7e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  26.67 
 
 
334 aa  50.4  8e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  26.67 
 
 
329 aa  50.4  9e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  27.03 
 
 
333 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  27.03 
 
 
333 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.54628e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  27.23 
 
 
329 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  23.03 
 
 
188 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  29.7 
 
 
425 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  23.03 
 
 
188 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  23.03 
 
 
188 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  23.03 
 
 
188 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  28.42 
 
 
329 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  26.22 
 
 
333 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  24.66 
 
 
317 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.57 
 
 
646 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  25.49 
 
 
200 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  26.73 
 
 
317 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  28.12 
 
 
328 aa  48.5  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  25.4 
 
 
577 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  22.08 
 
 
188 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  22.08 
 
 
188 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  22.08 
 
 
188 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  22.08 
 
 
188 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  22.08 
 
 
188 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  25.94 
 
 
363 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  22.08 
 
 
188 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  22.08 
 
 
188 aa  47.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  22.08 
 
 
188 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  22.08 
 
 
188 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  26.23 
 
 
314 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  25 
 
 
655 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  26 
 
 
307 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  23.04 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  22.49 
 
 
650 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  25.23 
 
 
333 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  22.76 
 
 
166 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  27.66 
 
 
156 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  26.27 
 
 
316 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  27.51 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  23.74 
 
 
316 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  25.81 
 
 
316 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1998  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  25.52 
 
 
197 aa  45.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  24.23 
 
 
712 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.34554e-07  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.97 
 
 
656 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  25.91 
 
 
321 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  27.03 
 
 
1110 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  26.88 
 
 
304 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.84 
 
 
333 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  23.36 
 
 
449 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  23.11 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  26.36 
 
 
321 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.81816e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  26.36 
 
 
319 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  25.26 
 
 
883 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  25.4 
 
 
540 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>