19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0075 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0075  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.95667e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0092  hypothetical protein  90.32 
 
 
186 aa  347  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0068181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0123  hypothetical protein  56.76 
 
 
184 aa  225  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00112268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0102  hypothetical protein  52.97 
 
 
184 aa  200  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.38688e-05  normal  0.914343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0272  hypothetical protein  49.73 
 
 
181 aa  183  1e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.168865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0701  hypothetical protein  42.7 
 
 
189 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.154886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0500  hypothetical protein  40.44 
 
 
205 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  7.08354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0016  hypothetical protein  32.67 
 
 
237 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2935  hypothetical protein  33.52 
 
 
177 aa  104  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.23691e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0015  hypothetical protein  28.04 
 
 
246 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0015  hypothetical protein  26.79 
 
 
241 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0015  hypothetical protein  27.31 
 
 
248 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0269  hypothetical protein  22.06 
 
 
202 aa  56.6  2e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.403479  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0352  hypothetical protein  32.22 
 
 
360 aa  54.7  7e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1904  hypothetical protein  37.31 
 
 
559 aa  54.3  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3424  hypothetical protein  34.43 
 
 
543 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.163574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3488  hypothetical protein  34.43 
 
 
543 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3343  hypothetical protein  34.43 
 
 
541 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3409  hypothetical protein  34.43 
 
 
545 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0767793  normal  0.404004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>