95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0071 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  46.28 
 
 
1303 aa  857  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  56.81 
 
 
1363 aa  1273  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  46.39 
 
 
1272 aa  886  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  46.97 
 
 
1736 aa  844  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  92.3 
 
 
1299 aa  2362  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  56.54 
 
 
1363 aa  1264  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  44.76 
 
 
1601 aa  832  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  53.16 
 
 
1430 aa  1125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  36.88 
 
 
1247 aa  640  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  100 
 
 
1299 aa  2633  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35326e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  42.82 
 
 
1201 aa  671  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  56.17 
 
 
1380 aa  1274  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  36.2 
 
 
1248 aa  627  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  37.56 
 
 
1973 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  51.19 
 
 
1308 aa  396  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  41.55 
 
 
734 aa  131  7e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  36.07 
 
 
480 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  34.32 
 
 
625 aa  102  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  35.99 
 
 
836 aa  94.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.12 
 
 
3507 aa  89.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  31.76 
 
 
798 aa  88.2  1e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  32.29 
 
 
647 aa  87.4  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  30.97 
 
 
661 aa  86.3  4e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  38.46 
 
 
708 aa  83.6  2e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  30.04 
 
 
799 aa  84  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  30.9 
 
 
798 aa  83.6  3e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  30.39 
 
 
620 aa  79.3  4e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.1 
 
 
4433 aa  78.6  7e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  29.7 
 
 
625 aa  77.8  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  37.74 
 
 
523 aa  77.4  2e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  37.86 
 
 
841 aa  76.6  3e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  28.63 
 
 
631 aa  76.3  4e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  31.56 
 
 
779 aa  74.7  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  37.5 
 
 
647 aa  73.9  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  30.2 
 
 
779 aa  72.8  4e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  26.49 
 
 
872 aa  72.8  4e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  27.24 
 
 
528 aa  72.4  5e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  39.2 
 
 
698 aa  72.4  5e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  33.52 
 
 
1042 aa  69.3  5e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  32.52 
 
 
676 aa  68.9  5e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  31.12 
 
 
677 aa  68.6  7e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  33.72 
 
 
840 aa  68.6  7e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  29.14 
 
 
779 aa  68.6  8e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  32.43 
 
 
643 aa  67.8  1e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  34.83 
 
 
409 aa  67  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  33.53 
 
 
1094 aa  66.2  4e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  7.01868e-05 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  30.61 
 
 
861 aa  65.5  7e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  9.1275e-07  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  35.59 
 
 
536 aa  64.7  1e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  28.03 
 
 
687 aa  63.9  2e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  28 
 
 
706 aa  62.4  5e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  25.57 
 
 
496 aa  58.2  9e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  27.62 
 
 
670 aa  58.5  9e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  51.67 
 
 
340 aa  57.8  2e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  36.44 
 
 
506 aa  57  2e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.44 
 
 
9585 aa  57  2e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.93 
 
 
508 aa  57.4  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.46 
 
 
505 aa  56.2  4e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  31.91 
 
 
999 aa  55.8  5e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  31.86 
 
 
2334 aa  55.8  6e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  25.68 
 
 
527 aa  55.8  6e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  32.23 
 
 
515 aa  55.5  8e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.4 
 
 
486 aa  54.7  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  31.4 
 
 
487 aa  53.9  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  25.61 
 
 
512 aa  53.5  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  26.19 
 
 
995 aa  53.5  3e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  8.29414e-07 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.85 
 
 
2068 aa  52  7e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 
1377 aa  51.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  41.67 
 
 
490 aa  50.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  35.48 
 
 
448 aa  50.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  27.48 
 
 
701 aa  50.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  30.54 
 
 
918 aa  50.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 
3333 aa  50.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  25.85 
 
 
502 aa  50.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  25.85 
 
 
502 aa  50.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  30.37 
 
 
715 aa  49.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  29.48 
 
 
628 aa  49.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  28.4 
 
 
741 aa  49.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  26.35 
 
 
516 aa  48.9  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.35 
 
 
776 aa  48.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  34.27 
 
 
569 aa  48.5  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  28.3 
 
 
471 aa  48.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  34.81 
 
 
1067 aa  48.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  34.11 
 
 
1113 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  23.96 
 
 
674 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  2.59399e-05  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.44 
 
 
532 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.63 
 
 
795 aa  46.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.03992e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  26.75 
 
 
760 aa  46.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  30.26 
 
 
771 aa  45.8  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  28.12 
 
 
2286 aa  46.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  30.94 
 
 
519 aa  46.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  25.64 
 
 
474 aa  45.8  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  37.14 
 
 
536 aa  45.8  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  25.64 
 
 
474 aa  45.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  25.64 
 
 
474 aa  45.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  33.96 
 
 
692 aa  45.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>