More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0069 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
279 aa  573  1e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  96.42 
 
 
279 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  64.62 
 
 
290 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  63.27 
 
 
281 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  58.6 
 
 
286 aa  361  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  56.88 
 
 
277 aa  331  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  56.36 
 
 
277 aa  325  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  55.23 
 
 
277 aa  318  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 
277 aa  308  6e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 
294 aa  306  2e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3228  alpha/beta hydrolase fold protein  53.6 
 
 
278 aa  295  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  54.45 
 
 
278 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  54.18 
 
 
276 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  54.45 
 
 
278 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  50.9 
 
 
280 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  52.52 
 
 
278 aa  288  6e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  53.74 
 
 
278 aa  288  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  53.74 
 
 
278 aa  288  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  53.74 
 
 
278 aa  288  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  53.74 
 
 
278 aa  288  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  51.8 
 
 
278 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  53.38 
 
 
278 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  51.91 
 
 
272 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34740  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.8 
 
 
280 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0253397  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 
272 aa  273  2e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 
272 aa  270  3e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 
272 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  49.24 
 
 
272 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  48.59 
 
 
297 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  47.31 
 
 
275 aa  266  3e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  46.21 
 
 
276 aa  266  3e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  49.05 
 
 
273 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  49.62 
 
 
273 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
278 aa  262  5e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  48.47 
 
 
272 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  47.33 
 
 
273 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  49.25 
 
 
278 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  49.25 
 
 
272 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
272 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 
297 aa  248  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  47.31 
 
 
281 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
269 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 
273 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  43.82 
 
 
292 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  46.64 
 
 
278 aa  239  3e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 
273 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 
273 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  44.6 
 
 
273 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.97 
 
 
281 aa  238  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 
286 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  46.07 
 
 
281 aa  234  1e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  44.8 
 
 
317 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  44.66 
 
 
334 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  44.66 
 
 
274 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  42.96 
 
 
273 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  47.01 
 
 
273 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  44.91 
 
 
273 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  42.97 
 
 
330 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 
273 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 
274 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4189  chloride peroxidase  51.66 
 
 
257 aa  222  5e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  46.27 
 
 
273 aa  221  1e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 
235 aa  220  2e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  42.21 
 
 
322 aa  220  2e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  42.75 
 
 
273 aa  220  2e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 
273 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
277 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
277 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
277 aa  219  4e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  42.24 
 
 
273 aa  219  4e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  41.06 
 
 
280 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  42.24 
 
 
273 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  43.68 
 
 
273 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
273 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 
273 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  40.79 
 
 
324 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
324 aa  216  3e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  40.86 
 
 
275 aa  216  3e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 
273 aa  215  6e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
274 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 
276 aa  213  2e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 
340 aa  213  4e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 
274 aa  213  4e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  42.97 
 
 
274 aa  211  8e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  41.83 
 
 
290 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 
338 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.93 
 
 
273 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 
275 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  38.35 
 
 
275 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 
277 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 
328 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
272 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
273 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  39.55 
 
 
274 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  39.55 
 
 
274 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  42.24 
 
 
326 aa  201  1e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  41.44 
 
 
273 aa  201  1e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  39.7 
 
 
274 aa  201  1e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  40 
 
 
324 aa  200  2e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
274 aa  198  8e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>