More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0068 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  92.78 
 
 
389 aa  740  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  794  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  73.97 
 
 
389 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  68.89 
 
 
391 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  67.18 
 
 
391 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  63.66 
 
 
387 aa  492  1e-138  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  37.91 
 
 
395 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  39.44 
 
 
391 aa  253  4e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  37.76 
 
 
393 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  38.83 
 
 
392 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  38.68 
 
 
392 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  38.17 
 
 
392 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  36.88 
 
 
392 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  36.58 
 
 
387 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  33.77 
 
 
389 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  35.34 
 
 
387 aa  221  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  34.91 
 
 
391 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  37.18 
 
 
390 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  8.5327e-06 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  35 
 
 
393 aa  196  5e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  33.24 
 
 
392 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
400 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  32.77 
 
 
399 aa  185  1e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  30.37 
 
 
451 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 
409 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 
400 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  31.34 
 
 
403 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  28.37 
 
 
388 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 
402 aa  155  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  27.32 
 
 
394 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 
401 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30.33 
 
 
414 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  31.78 
 
 
398 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  28.5 
 
 
388 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.03276e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  31.38 
 
 
401 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  26.87 
 
 
387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  31.78 
 
 
398 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  31.51 
 
 
398 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  28.11 
 
 
402 aa  149  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  25.14 
 
 
388 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  29.08 
 
 
405 aa  147  2e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  26.51 
 
 
391 aa  147  2e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  29.41 
 
 
405 aa  147  4e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 
396 aa  146  8e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  26.77 
 
 
381 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.99 
 
 
398 aa  145  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  24.79 
 
 
391 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  30.35 
 
 
379 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  27.93 
 
 
370 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  30.08 
 
 
381 aa  142  1e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 
415 aa  142  1e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  29.19 
 
 
410 aa  141  2e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 
415 aa  140  4e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  28.76 
 
 
409 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  26.82 
 
 
384 aa  139  8e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  28.73 
 
 
398 aa  139  8e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 
402 aa  139  8e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 
385 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  28.93 
 
 
393 aa  137  3e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.23 
 
 
367 aa  137  3e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  27.67 
 
 
417 aa  137  3e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  29.88 
 
 
410 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  28.96 
 
 
392 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 
381 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  27.93 
 
 
379 aa  136  6e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  30.27 
 
 
382 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  29.05 
 
 
387 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  28.15 
 
 
413 aa  135  1e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  28.33 
 
 
397 aa  135  1e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  28.04 
 
 
412 aa  135  1e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.08657e-08 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  27.57 
 
 
370 aa  135  1e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  27.55 
 
 
405 aa  135  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  28.69 
 
 
371 aa  134  2e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.26 
 
 
377 aa  134  2e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  27.96 
 
 
412 aa  135  2e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  135  2e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.26 
 
 
377 aa  134  2e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.57 
 
 
392 aa  134  2e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.65 
 
 
384 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  27.02 
 
 
387 aa  134  4e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  27.86 
 
 
401 aa  133  4e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  27.57 
 
 
411 aa  134  4e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  27.27 
 
 
405 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  28.68 
 
 
402 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 
415 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  28.96 
 
 
387 aa  133  7e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  27.55 
 
 
405 aa  132  7e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  28.73 
 
 
388 aa  132  8e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  24.48 
 
 
385 aa  132  8e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  132  1e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  27.88 
 
 
401 aa  132  1e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  28.49 
 
 
406 aa  132  1e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  29.56 
 
 
394 aa  131  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  131  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  25.07 
 
 
395 aa  131  2e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.89 
 
 
379 aa  131  2e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  27.82 
 
 
382 aa  131  2e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 
384 aa  131  2e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>