More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0066 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 
552 aa  1119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.36428e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  95.29 
 
 
552 aa  1073  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  52.81 
 
 
552 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3401  general secretory system II, protein E-like  46.46 
 
 
540 aa  508  1e-142  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  46.36 
 
 
549 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  43.4 
 
 
550 aa  446  1e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3220  General secretory system II protein E domain protein  43.17 
 
 
550 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  26.82 
 
 
564 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  24.77 
 
 
561 aa  176  1e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  27.04 
 
 
553 aa  174  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  26.28 
 
 
557 aa  173  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  24.77 
 
 
557 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  25.67 
 
 
556 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  24.75 
 
 
570 aa  169  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  25.36 
 
 
565 aa  169  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  24.8 
 
 
558 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  24.91 
 
 
554 aa  163  8e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  23.18 
 
 
567 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  26.25 
 
 
559 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  22 
 
 
564 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  24.91 
 
 
599 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  24.91 
 
 
599 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  22.7 
 
 
570 aa  159  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  23.45 
 
 
570 aa  159  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  23.85 
 
 
603 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  24.96 
 
 
599 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  25.53 
 
 
589 aa  156  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  21.93 
 
 
558 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  25.26 
 
 
553 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  24.42 
 
 
612 aa  154  3e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  23.35 
 
 
571 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  25.65 
 
 
553 aa  153  9e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  23.68 
 
 
553 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  22.68 
 
 
573 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  24.51 
 
 
568 aa  149  1e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  26.27 
 
 
688 aa  149  2e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  23.09 
 
 
568 aa  147  4e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.18 
 
 
568 aa  147  4e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  23.03 
 
 
562 aa  147  4e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.49 
 
 
568 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  23.54 
 
 
586 aa  146  8e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  23.52 
 
 
577 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.27 
 
 
568 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  24.87 
 
 
568 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.27 
 
 
568 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  23.08 
 
 
568 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  24.9 
 
 
585 aa  144  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  25.97 
 
 
571 aa  143  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  22.93 
 
 
555 aa  143  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  22.96 
 
 
545 aa  142  1e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  22.42 
 
 
568 aa  142  1e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  25.98 
 
 
561 aa  142  1e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  25.44 
 
 
577 aa  143  1e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  22.44 
 
 
563 aa  142  2e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  22.07 
 
 
561 aa  141  4e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.27 
 
 
568 aa  140  8e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  22.03 
 
 
577 aa  139  9e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  21.98 
 
 
587 aa  140  9e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  21.64 
 
 
586 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  23.58 
 
 
574 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  22.85 
 
 
558 aa  138  3e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  24.25 
 
 
561 aa  138  3e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.85 
 
 
571 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  22.1 
 
 
806 aa  137  6e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  22.31 
 
 
871 aa  137  6e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  22.24 
 
 
823 aa  136  1e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.84 
 
 
568 aa  136  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  21.71 
 
 
584 aa  135  1e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.31 
 
 
568 aa  136  1e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  25.93 
 
 
571 aa  135  2e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  24.57 
 
 
594 aa  135  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  22.63 
 
 
885 aa  135  2e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.11 
 
 
568 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  22.03 
 
 
586 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  23.21 
 
 
573 aa  133  7e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  23.73 
 
 
547 aa  133  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  21.55 
 
 
585 aa  132  1e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  21.83 
 
 
586 aa  132  2e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  22.79 
 
 
566 aa  132  2e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  22.59 
 
 
554 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  23.12 
 
 
568 aa  131  4e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  21.6 
 
 
637 aa  131  4e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  21.93 
 
 
571 aa  131  4e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  22.26 
 
 
576 aa  130  5e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  6.42239e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  22.48 
 
 
569 aa  130  7e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  22.08 
 
 
586 aa  130  8e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  21.07 
 
 
561 aa  130  8e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  23.11 
 
 
891 aa  129  2e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  21.69 
 
 
787 aa  129  2e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  24.27 
 
 
550 aa  129  2e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  21.65 
 
 
586 aa  129  2e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  21.65 
 
 
586 aa  129  2e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  23.08 
 
 
567 aa  128  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  21.47 
 
 
586 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  21.08 
 
 
888 aa  127  4e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  20.55 
 
 
586 aa  126  8e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  21.28 
 
 
586 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  21.28 
 
 
586 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  21.5 
 
 
570 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  22.22 
 
 
582 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>