11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0060 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22132e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0077  hypothetical protein  95.92 
 
 		 245 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000844228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4425  hypothetical protein  65.69 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3557  putative lipoprotein  60.5 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3462  putative lipoprotein  63.03 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0935  putative lipoprotein  51.3 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3619  putative lipoprotein  48.36 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1926  putative lipoprotein  46.47 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2428  putative lipoprotein  49.15 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000405062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1584  hypothetical protein  42.38 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0011  hypothetical protein  32.84 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0855925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>