More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0058 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 
226 aa  463  1e-130  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.20235e-15 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  91.15 
 
 
227 aa  430  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40.44 
 
 
233 aa  172  4e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.67 
 
 
236 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  34.78 
 
 
237 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38709e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  35.47 
 
 
237 aa  164  1e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  36.49 
 
 
248 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 
233 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  44.65 
 
 
240 aa  151  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.12 
 
 
240 aa  147  1e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3263  response regulator  31.78 
 
 
231 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.23 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
124 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  42.16 
 
 
123 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
123 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.07 
 
 
1053 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
123 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1193 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1193 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 
121 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  33.33 
 
 
121 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
124 aa  88.6  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 
122 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
123 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
126 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  34.17 
 
 
121 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 
121 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
126 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  32.5 
 
 
121 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 
121 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.45 
 
 
2336 aa  85.5  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1013 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  32.5 
 
 
126 aa  83.6  2e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  28.33 
 
 
123 aa  83.6  2e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  35.58 
 
 
2301 aa  83.6  2e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  32.5 
 
 
126 aa  83.6  2e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
130 aa  83.6  3e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  28.33 
 
 
134 aa  83.2  3e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  28.33 
 
 
123 aa  83.6  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  39.22 
 
 
123 aa  83.2  3e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.74 
 
 
2301 aa  82.8  4e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0599  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
123 aa  82.4  5e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.44338  hitchhiker  6.72903e-11 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  29.17 
 
 
123 aa  82  6e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.54 
 
 
235 aa  82.4  6e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
144 aa  82  6e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
126 aa  82  7e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  29.17 
 
 
127 aa  82  7e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  34.23 
 
 
132 aa  81.6  8e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
124 aa  81.6  8e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  34.58 
 
 
458 aa  81.6  8e-15  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  40 
 
 
647 aa  82  8e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
1274 aa  82  8e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 
231 aa  81.6  9e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
1907 aa  81.3  1e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
123 aa  80.9  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  31.93 
 
 
121 aa  81.3  1e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  27.5 
 
 
123 aa  80.9  1e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 
231 aa  81.3  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  28.33 
 
 
123 aa  81.3  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
130 aa  81.3  1e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  35.51 
 
 
285 aa  81.6  1e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 
121 aa  81.3  1e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
125 aa  81.3  1e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.85 
 
 
236 aa  80.9  2e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
123 aa  80.1  2e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  31.51 
 
 
304 aa  80.1  2e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  27.5 
 
 
123 aa  80.5  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  27.5 
 
 
123 aa  80.5  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
132 aa  80.1  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35 
 
 
858 aa  80.5  2e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  31.9 
 
 
123 aa  79.7  3e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
2212 aa  79.7  3e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  37.25 
 
 
121 aa  80.1  3e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  33.02 
 
 
460 aa  80.1  3e-14  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  38.1 
 
 
204 aa  79.7  3e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  42.73 
 
 
456 aa  80.1  3e-14  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4279  response regulator receiver protein  29.52 
 
 
232 aa  79.3  4e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254527  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  33.03 
 
 
132 aa  79.7  4e-14  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.14 
 
 
464 aa  79.3  4e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
2414 aa  79.7  4e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  31.86 
 
 
2284 aa  79.3  4e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  30.91 
 
 
1987 aa  79  5e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  27.07 
 
 
239 aa  79  5e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.55004e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  33.64 
 
 
458 aa  79  5e-14  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  28.81 
 
 
2476 aa  79  5e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  41.18 
 
 
1765 aa  79.3  5e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
125 aa  79.3  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  31.35 
 
 
1361 aa  79.3  5e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1767 aa  79  6e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  28.81 
 
 
2458 aa  79  6e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1767 aa  78.6  7e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
500 aa  78.6  7e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35.85 
 
 
124 aa  78.6  8e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 
385 aa  78.6  8e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.06 
 
 
1560 aa  78.2  9e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
870 aa  78.2  9e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
132 aa  78.2  9e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.83 
 
 
328 aa  78.2  1e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1771 aa  77.8  1e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>