More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0057 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  100 
 
 
588 aa  1204  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.85994e-13 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  91.52 
 
 
578 aa  1045  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.16 
 
 
785 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.4 
 
 
817 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  48.21 
 
 
968 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 
781 aa  358  1e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  48.74 
 
 
982 aa  357  4e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
764 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 
724 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 
631 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  44.01 
 
 
661 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  43.36 
 
 
793 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.65 
 
 
902 aa  340  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  44.34 
 
 
651 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
604 aa  339  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.97 
 
 
631 aa  339  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  44.69 
 
 
651 aa  338  1e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 
874 aa  338  1e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
1127 aa  338  2e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 
643 aa  337  3e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.27 
 
 
765 aa  337  4e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.15 
 
 
544 aa  336  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
643 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.68 
 
 
718 aa  333  7e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.25842e-05 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
1433 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.86 
 
 
645 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  44.47 
 
 
1023 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
962 aa  331  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  43.7 
 
 
1193 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.39 
 
 
620 aa  330  5e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.41 
 
 
1791 aa  330  5e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 
947 aa  329  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.88 
 
 
846 aa  329  9e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
643 aa  329  1e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 
896 aa  329  1e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
643 aa  328  2e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  45.43 
 
 
772 aa  327  4e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  36.56 
 
 
544 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
633 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  35.37 
 
 
598 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 
882 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  42.79 
 
 
736 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.08 
 
 
932 aa  322  1e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  39.59 
 
 
671 aa  322  1e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.25 
 
 
995 aa  322  2e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.2 
 
 
1135 aa  321  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  46.87 
 
 
735 aa  320  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  41.39 
 
 
1560 aa  320  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
1452 aa  320  7e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.8 
 
 
1199 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  44.62 
 
 
882 aa  319  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.8 
 
 
582 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  42.09 
 
 
641 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  43.84 
 
 
764 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  40.95 
 
 
732 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  39.05 
 
 
676 aa  317  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.12 
 
 
777 aa  317  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
1691 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 
860 aa  316  1e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.18 
 
 
965 aa  315  1e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
631 aa  315  2e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.8 
 
 
1028 aa  315  2e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 
969 aa  314  2e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  44.42 
 
 
606 aa  315  2e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.62 
 
 
763 aa  314  3e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
959 aa  314  3e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.54 
 
 
606 aa  314  3e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.73 
 
 
1350 aa  314  3e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  45.57 
 
 
853 aa  313  4e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  42.33 
 
 
641 aa  313  4e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
1195 aa  313  5e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 
945 aa  312  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
781 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  44.63 
 
 
589 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  34.66 
 
 
528 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 
1287 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
645 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
1204 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
974 aa  311  3e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.14 
 
 
738 aa  310  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
791 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
667 aa  310  6e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
969 aa  310  6e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  41.96 
 
 
666 aa  310  6e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.17 
 
 
1169 aa  309  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
865 aa  309  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
969 aa  308  1e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  43 
 
 
794 aa  308  1e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
916 aa  308  2e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
863 aa  308  2e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.27 
 
 
659 aa  308  2e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 
717 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.1 
 
 
866 aa  307  4e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.91 
 
 
940 aa  307  4e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1310 aa  306  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
907 aa  306  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
572 aa  306  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
743 aa  306  8e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 
1226 aa  306  8e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
1070 aa  306  9e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>