More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0054 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  100 
 
 
392 aa  801  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77087e-11 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  95.32 
 
 
385 aa  756  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  65.35 
 
 
385 aa  525  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  67.73 
 
 
383 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  58.73 
 
 
381 aa  471  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  59.06 
 
 
386 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  57.51 
 
 
387 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  58.67 
 
 
376 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  50.13 
 
 
383 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  47.47 
 
 
379 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  48.83 
 
 
385 aa  362  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  47.33 
 
 
384 aa  357  2e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  48.06 
 
 
390 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  48.08 
 
 
390 aa  352  9e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  40.75 
 
 
375 aa  326  4e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  42.13 
 
 
378 aa  321  1e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  39.9 
 
 
391 aa  310  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  45.36 
 
 
393 aa  303  4e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
386 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 
390 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  42.11 
 
 
401 aa  292  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 
521 aa  288  8e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  42.09 
 
 
386 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  41.78 
 
 
395 aa  285  1e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  41.05 
 
 
391 aa  284  2e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  36.6 
 
 
383 aa  283  3e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  35.26 
 
 
383 aa  282  8e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  41.65 
 
 
391 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  41.54 
 
 
396 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 
393 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 
386 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  35.54 
 
 
383 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  36.07 
 
 
383 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  35.54 
 
 
383 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  35.81 
 
 
383 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  35.54 
 
 
383 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  35.54 
 
 
383 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  36.15 
 
 
393 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.03791e-05  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  42.03 
 
 
409 aa  277  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 
392 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  35.54 
 
 
383 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  43.47 
 
 
405 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  36.15 
 
 
393 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  38.14 
 
 
393 aa  275  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  35.28 
 
 
383 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  35.28 
 
 
383 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 
393 aa  275  1e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 
393 aa  274  2e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  6.80188e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  40.31 
 
 
394 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  2.99069e-08 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  38.66 
 
 
391 aa  269  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.14817e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 
412 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  36.8 
 
 
372 aa  259  8e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 
394 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  37.73 
 
 
390 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  5.60226e-05 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 
393 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 
390 aa  255  1e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  35.4 
 
 
389 aa  254  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  40 
 
 
398 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  37.18 
 
 
400 aa  253  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  35.95 
 
 
397 aa  252  9e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  4.74096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 
390 aa  252  9e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  38.24 
 
 
390 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  38.02 
 
 
399 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  37.82 
 
 
394 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 
386 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  35.52 
 
 
399 aa  246  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  39.84 
 
 
385 aa  246  5e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 
385 aa  246  5e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  35 
 
 
404 aa  245  9e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  37.14 
 
 
389 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  37.57 
 
 
514 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  38.97 
 
 
390 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  34.45 
 
 
394 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  34.35 
 
 
395 aa  236  5e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  34.1 
 
 
397 aa  235  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.48039e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
390 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  32.55 
 
 
383 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  35.06 
 
 
390 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  36.08 
 
 
390 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  3.88923e-08  unclonable  5.8197e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  32.65 
 
 
386 aa  228  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 
386 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  32.55 
 
 
387 aa  228  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 
391 aa  226  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  37.92 
 
 
414 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  32.75 
 
 
397 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  8.68394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  33.92 
 
 
396 aa  221  1e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  32.55 
 
 
387 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10930  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  34.32 
 
 
405 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34112  unclonable  3.28438e-09 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 
392 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 
386 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  34.11 
 
 
392 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28388  predicted protein  38.78 
 
 
389 aa  216  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0426806  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 
390 aa  215  1e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  35.4 
 
 
393 aa  214  2e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 
392 aa  214  2e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 
400 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  31.28 
 
 
388 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  30.83 
 
 
396 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  36.24 
 
 
383 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  30.71 
 
 
389 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>