272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0052 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.95021e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  89.94 
 
 
335 aa  574  1e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  57.38 
 
 
347 aa  357  1e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3011  peptidase M28  40.29 
 
 
325 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844179  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3053  peptidase M28  40.29 
 
 
325 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.387481 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  37.97 
 
 
356 aa  201  9e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  38.89 
 
 
323 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  38.89 
 
 
323 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  40.82 
 
 
273 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  38.3 
 
 
299 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  40.7 
 
 
321 aa  173  4e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3437  peptidase M28  37.41 
 
 
453 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  37.07 
 
 
282 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  35.49 
 
 
306 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  35.74 
 
 
305 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  34.81 
 
 
306 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  34.51 
 
 
333 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  36.25 
 
 
339 aa  130  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.36 
 
 
1103 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  27.41 
 
 
512 aa  84  3e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  26.02 
 
 
430 aa  83.2  5e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  33.05 
 
 
674 aa  82  1e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  30.83 
 
 
437 aa  73.2  5e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  29.69 
 
 
462 aa  73.2  5e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  29.58 
 
 
408 aa  72.8  7e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  29.61 
 
 
319 aa  72  1e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  26.29 
 
 
434 aa  72  1e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  5.18672e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  28.44 
 
 
677 aa  71.2  2e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  28.91 
 
 
384 aa  71.2  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  30.4 
 
 
1247 aa  70.5  3e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  29.11 
 
 
384 aa  70.5  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  28.02 
 
 
417 aa  70.5  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  29.11 
 
 
408 aa  70.5  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  29.11 
 
 
384 aa  70.5  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  29.11 
 
 
384 aa  70.5  3e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  28.02 
 
 
417 aa  70.5  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  29.11 
 
 
408 aa  70.5  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  29.11 
 
 
408 aa  70.5  3e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  29.11 
 
 
417 aa  70.1  4e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.7 
 
 
391 aa  70.5  4e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  32.76 
 
 
775 aa  69.3  8e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  27.59 
 
 
417 aa  68.9  9e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  25.57 
 
 
574 aa  68.9  9e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  28.17 
 
 
417 aa  68.6  1e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.16 
 
 
417 aa  68.6  1e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  33.52 
 
 
502 aa  68.2  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  25.08 
 
 
591 aa  66.6  4e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  37.5 
 
 
454 aa  67  4e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.2 
 
 
555 aa  66.2  6e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  26.25 
 
 
481 aa  66.6  6e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.49349e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  24.19 
 
 
407 aa  66.2  7e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  29.95 
 
 
312 aa  65.9  8e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  24.42 
 
 
407 aa  65.5  1e-09  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.4 
 
 
1131 aa  64.7  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  35.25 
 
 
947 aa  64.3  2e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  24.13 
 
 
568 aa  64.3  3e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  29.23 
 
 
338 aa  63.9  3e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  36.63 
 
 
465 aa  63.9  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  35.64 
 
 
466 aa  63.5  4e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  35.64 
 
 
466 aa  63.5  4e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  35.64 
 
 
466 aa  63.5  4e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  23.53 
 
 
476 aa  63.5  4e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  35.64 
 
 
466 aa  63.5  4e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.01 
 
 
466 aa  63.2  6e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  30.13 
 
 
291 aa  62.8  7e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  26.01 
 
 
466 aa  62.4  9e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  32.37 
 
 
309 aa  62.4  9e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  26.01 
 
 
466 aa  62.4  9e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.34 
 
 
466 aa  62  1e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  27.27 
 
 
466 aa  62  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 
580 aa  61.2  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  24.09 
 
 
598 aa  61.2  2e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.55 
 
 
466 aa  61.6  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  31.49 
 
 
313 aa  60.1  4e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  35.51 
 
 
424 aa  60.1  5e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  29.1 
 
 
518 aa  59.7  6e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  37.86 
 
 
512 aa  59.7  7e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  41.3 
 
 
467 aa  59.3  7e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.20691e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  30.43 
 
 
472 aa  59.3  8e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.18 
 
 
584 aa  59.3  9e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  38.89 
 
 
535 aa  58.9  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  28.89 
 
 
519 aa  58.5  1e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  24.55 
 
 
629 aa  58.9  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  28.7 
 
 
477 aa  58.5  1e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  33.09 
 
 
1147 aa  58.2  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  48.33 
 
 
457 aa  58.2  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  23.72 
 
 
323 aa  57.8  2e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.58 
 
 
481 aa  57.8  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  38.89 
 
 
536 aa  58.2  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  28.52 
 
 
488 aa  57.4  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  28.85 
 
 
523 aa  57.4  3e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  41.18 
 
 
525 aa  57  4e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.62 
 
 
579 aa  57  4e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  25.62 
 
 
397 aa  57  4e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  33.09 
 
 
373 aa  56.6  5e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  39.73 
 
 
394 aa  56.2  6e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  31.75 
 
 
1077 aa  56.2  6e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  24.46 
 
 
352 aa  56.2  7e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.61 
 
 
318 aa  56.2  7e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  25.46 
 
 
455 aa  56.2  7e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>