More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0051 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
333 aa  676  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.73223e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  88.36 
 
 
333 aa  504  1e-142  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  63.5 
 
 
434 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  62.19 
 
 
432 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  47.74 
 
 
443 aa  184  2e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.28786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  47.79 
 
 
417 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.26931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  55.2 
 
 
466 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  55.56 
 
 
429 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  48.8 
 
 
454 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.20866e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  52.99 
 
 
447 aa  132  1e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.85785e-13  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  51.85 
 
 
457 aa  127  4e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  50.96 
 
 
210 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  46.67 
 
 
350 aa  121  2e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  46.67 
 
 
350 aa  121  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.84221e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  40.51 
 
 
468 aa  120  2e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.80584e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  45.38 
 
 
344 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  52.48 
 
 
427 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.92 
 
 
344 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.82424e-07  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  46.15 
 
 
344 aa  119  1e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  3.00566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  44.7 
 
 
459 aa  117  2e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  44.7 
 
 
459 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  48.08 
 
 
351 aa  115  8e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  44.19 
 
 
466 aa  115  1e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08671e-14 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  42.96 
 
 
344 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  3.49757e-05  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  42.96 
 
 
344 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  48.08 
 
 
327 aa  114  2e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  42.96 
 
 
345 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  2.81488e-06  decreased coverage  1.76342e-11 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  42.96 
 
 
344 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.17848e-08  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  48.21 
 
 
209 aa  112  8e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  40.77 
 
 
314 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  51.89 
 
 
440 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
376 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  1.02046e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  39.16 
 
 
381 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  9.77039e-05  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  43.31 
 
 
169 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 
375 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 
428 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.18101e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 
359 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 
401 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  50.5 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  49.5 
 
 
478 aa  99.4  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  42.4 
 
 
380 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.68113e-11  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 
236 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  46.09 
 
 
630 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  46.08 
 
 
218 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  49.02 
 
 
296 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  46.08 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  48.51 
 
 
209 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
215 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.61 
 
 
168 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.5 
 
 
537 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  45.54 
 
 
224 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.06819e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 
218 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  48.51 
 
 
212 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  46.08 
 
 
261 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  46.08 
 
 
261 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
219 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
219 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
219 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
449 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 
209 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  34.56 
 
 
240 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  46.08 
 
 
260 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  41.18 
 
 
352 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 
440 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 
205 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  41.86 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  1.95152e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  38.76 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  1.97596e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 
209 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  46.08 
 
 
331 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 
456 aa  92  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 
427 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  44.44 
 
 
233 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  6.20554e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  46.23 
 
 
217 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.64743e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
220 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 
231 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  38.28 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  7.25554e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  46.08 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
206 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
218 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
220 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.23 
 
 
217 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.10424e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
445 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.95 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 
221 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  45.1 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
206 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  44.12 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
510 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
219 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.36 
 
 
510 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 
219 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.75 
 
 
392 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.20544e-05  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
219 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
219 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>