More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0045 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
300 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  72.09 
 
 
301 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  57.95 
 
 
302 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  59.23 
 
 
288 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  47.16 
 
 
318 aa  306  4e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  46.82 
 
 
405 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  46.15 
 
 
426 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  46.02 
 
 
399 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  43.1 
 
 
408 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  39.93 
 
 
316 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
330 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  36.21 
 
 
311 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.36 
 
 
316 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  34.97 
 
 
342 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.98 
 
 
350 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  36.96 
 
 
337 aa  201  1e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  35.49 
 
 
329 aa  201  2e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  36.96 
 
 
337 aa  201  2e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  34.06 
 
 
351 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  36.3 
 
 
337 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  35.12 
 
 
330 aa  197  1e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 
389 aa  197  2e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  34.37 
 
 
350 aa  197  2e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  34.37 
 
 
350 aa  197  2e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  32.21 
 
 
358 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  35.67 
 
 
313 aa  196  5e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
314 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  34.11 
 
 
310 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.4 
 
 
359 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.35 
 
 
362 aa  180  3e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  33.79 
 
 
362 aa  180  3e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  34.69 
 
 
362 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 
318 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  32.53 
 
 
329 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.37 
 
 
321 aa  167  3e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.3 
 
 
384 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.61 
 
 
382 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  31.2 
 
 
382 aa  156  5e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  31.21 
 
 
382 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  31.21 
 
 
382 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 
388 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 
394 aa  147  1e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  27.75 
 
 
384 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  26.67 
 
 
444 aa  139  8e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  27.04 
 
 
391 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  29.32 
 
 
370 aa  131  2e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
367 aa  130  2e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
377 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  28.48 
 
 
311 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27.94 
 
 
377 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.66 
 
 
344 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
211 aa  118  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  27.93 
 
 
377 aa  118  1e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  27.95 
 
 
346 aa  117  2e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
330 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 
243 aa  114  2e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  27.92 
 
 
378 aa  114  2e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  26.38 
 
 
389 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  26.38 
 
 
389 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 
279 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.43 
 
 
324 aa  112  7e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  24.92 
 
 
359 aa  111  2e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  30.59 
 
 
269 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 
281 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.3174e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  25.68 
 
 
532 aa  109  4e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  25.8 
 
 
351 aa  110  4e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
304 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
525 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  25.29 
 
 
532 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  25.29 
 
 
532 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  25.36 
 
 
375 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  25.29 
 
 
532 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
525 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
525 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
525 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
517 aa  109  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
517 aa  109  7e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 
517 aa  109  7e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  24.44 
 
 
385 aa  108  8e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  26.43 
 
 
400 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  29.38 
 
 
255 aa  108  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  3.45466e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  32.76 
 
 
287 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  25.29 
 
 
531 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  24.66 
 
 
557 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  25.85 
 
 
380 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  24.85 
 
 
398 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.64 
 
 
525 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
279 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  25.72 
 
 
375 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
279 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  32.24 
 
 
279 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  24.81 
 
 
390 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  24.22 
 
 
544 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  23.05 
 
 
418 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 
279 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  31.61 
 
 
285 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  25.19 
 
 
538 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  27.45 
 
 
315 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  23.05 
 
 
418 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  25.72 
 
 
375 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>