More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0043 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
199 aa  396  1e-110  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  76.38 
 
 
199 aa  325  2e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  69 
 
 
200 aa  256  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  67.5 
 
 
200 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  58.79 
 
 
199 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  56.06 
 
 
199 aa  211  4e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  57.36 
 
 
198 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  60.61 
 
 
201 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  52.82 
 
 
209 aa  197  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  47.12 
 
 
224 aa  161  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  44.9 
 
 
226 aa  160  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  45.12 
 
 
235 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  45.12 
 
 
234 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  44.14 
 
 
234 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  41.21 
 
 
209 aa  152  3e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  41.21 
 
 
209 aa  152  3e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  41.41 
 
 
225 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  40.7 
 
 
209 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  38.38 
 
 
215 aa  146  2e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  41.03 
 
 
234 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  42.13 
 
 
211 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  37.07 
 
 
229 aa  137  9e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  35.84 
 
 
262 aa  134  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  42.71 
 
 
229 aa  134  1e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  38.78 
 
 
214 aa  133  2e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  43.62 
 
 
196 aa  133  2e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  42.71 
 
 
229 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  35.34 
 
 
259 aa  129  4e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  37.06 
 
 
211 aa  127  8e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  41.88 
 
 
209 aa  126  2e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  38.89 
 
 
215 aa  121  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.59 
 
 
206 aa  120  2e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  34.76 
 
 
243 aa  116  2e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  32.83 
 
 
219 aa  114  1e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  37.63 
 
 
225 aa  114  1e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  37.97 
 
 
832 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  34.18 
 
 
211 aa  110  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.14 
 
 
174 aa  109  2e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  36.02 
 
 
203 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  34.05 
 
 
194 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  35.94 
 
 
229 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  34.95 
 
 
202 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  48.28 
 
 
305 aa  102  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  34.38 
 
 
205 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.86 
 
 
819 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  34.67 
 
 
200 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  31.22 
 
 
197 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  9.75001e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.18 
 
 
204 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  34.18 
 
 
197 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  34.39 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  34.63 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  34.95 
 
 
201 aa  98.2  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33.17 
 
 
825 aa  97.8  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  38.62 
 
 
204 aa  97.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  34.52 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  32.8 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.24014e-05  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  31.72 
 
 
201 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  34.15 
 
 
240 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  34.22 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  33.17 
 
 
236 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  30.58 
 
 
239 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  33.65 
 
 
234 aa  91.7  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  31.25 
 
 
202 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  32.98 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  34.52 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
203 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  31.6 
 
 
827 aa  87.8  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 
224 aa  87.8  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
209 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  32.68 
 
 
241 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  29.21 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  30.1 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  31.75 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.64 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.43 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.29 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.43 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.29 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.21 
 
 
209 aa  84.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.89 
 
 
209 aa  84.3  1e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 
193 aa  84  1e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.24 
 
 
208 aa  84  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.89 
 
 
209 aa  84.3  1e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 
193 aa  84  1e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  30.46 
 
 
225 aa  84  1e-15  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  31.55 
 
 
193 aa  84  1e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 
283 aa  83.2  2e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  30.21 
 
 
212 aa  84  2e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  34.18 
 
 
248 aa  83.2  3e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5106  cytochrome c oxidase, subunit III  28.64 
 
 
205 aa  82.8  3e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0670031  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  29.44 
 
 
209 aa  82.4  4e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  29.44 
 
 
207 aa  82  5e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  32.34 
 
 
215 aa  82  5e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3075  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 
204 aa  82  6e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0780989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2221  cytochrome c oxidase, subunit III  30.16 
 
 
210 aa  81.3  8e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109522  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.19 
 
 
206 aa  81.3  8e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>