More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0042 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  77.49 
 
 
541 aa  841  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  69.19 
 
 
541 aa  736  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  66.41 
 
 
539 aa  724  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  84.64 
 
 
539 aa  933  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  71.59 
 
 
543 aa  738  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.23308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  77.45 
 
 
541 aa  860  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
542 aa  1073  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  69.19 
 
 
541 aa  707  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  67.78 
 
 
543 aa  706  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  55.6 
 
 
542 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  56.05 
 
 
565 aa  584  1e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  54.84 
 
 
548 aa  576  1e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  56.02 
 
 
564 aa  568  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  54.51 
 
 
556 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  53.73 
 
 
552 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  51.84 
 
 
544 aa  555  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  53.2 
 
 
563 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  52.82 
 
 
563 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  50.65 
 
 
545 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  52.82 
 
 
563 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  50.96 
 
 
555 aa  538  1e-152  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  50.75 
 
 
535 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  50.97 
 
 
558 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  51.36 
 
 
554 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  51.74 
 
 
565 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  52.87 
 
 
557 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  49.81 
 
 
540 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  50.67 
 
 
554 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  49.71 
 
 
554 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  49.71 
 
 
554 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 
558 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  50.19 
 
 
558 aa  516  1e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  53.04 
 
 
554 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  52.47 
 
 
555 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  52.66 
 
 
555 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  50.39 
 
 
528 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  45.4 
 
 
587 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  44.29 
 
 
555 aa  453  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  44.29 
 
 
555 aa  453  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  44.34 
 
 
564 aa  446  1e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  44.87 
 
 
560 aa  447  1e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.81 
 
 
541 aa  447  1e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  46.12 
 
 
588 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  42.75 
 
 
575 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  43.69 
 
 
590 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  45.19 
 
 
594 aa  439  1e-122  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  44.14 
 
 
559 aa  439  1e-122  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  42.66 
 
 
548 aa  439  1e-122  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  47.74 
 
 
589 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  45.58 
 
 
563 aa  433  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  44.23 
 
 
661 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  46.26 
 
 
595 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  42.75 
 
 
540 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  41.28 
 
 
555 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.69 
 
 
543 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.02 
 
 
536 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  45.58 
 
 
596 aa  432  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  46.12 
 
 
583 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  44.08 
 
 
594 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  42.27 
 
 
547 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  43.08 
 
 
534 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  46.6 
 
 
570 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  42 
 
 
565 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  47.16 
 
 
576 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  41.43 
 
 
615 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  44.79 
 
 
574 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  47.16 
 
 
576 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  40.62 
 
 
546 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  43.16 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  43.95 
 
 
569 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  44.05 
 
 
537 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  44.57 
 
 
560 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  47.16 
 
 
576 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  41.99 
 
 
539 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  44.47 
 
 
581 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 
535 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  42.5 
 
 
534 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  42.97 
 
 
535 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  41.28 
 
 
555 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  42.77 
 
 
535 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  42.36 
 
 
544 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  45.44 
 
 
580 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  42.88 
 
 
536 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  42.97 
 
 
535 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  41.65 
 
 
543 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  42.97 
 
 
535 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  43.27 
 
 
537 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  41.2 
 
 
638 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  40.56 
 
 
546 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  41.65 
 
 
531 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  43.16 
 
 
535 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  42.11 
 
 
534 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  46.21 
 
 
592 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  45.24 
 
 
581 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  42.32 
 
 
544 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  41.63 
 
 
555 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>