47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0041 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  82.85 
 
 
276 aa  477  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  65.95 
 
 
278 aa  318  8e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  60.15 
 
 
274 aa  312  3e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  57.02 
 
 
298 aa  273  2e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24859e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  45.42 
 
 
415 aa  234  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  45.04 
 
 
247 aa  222  5e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  44.94 
 
 
342 aa  221  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  46.86 
 
 
313 aa  218  8e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.75275e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  40.44 
 
 
277 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  36.55 
 
 
299 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  37.93 
 
 
283 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  32.49 
 
 
291 aa  141  1e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  32.49 
 
 
291 aa  141  1e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  32.48 
 
 
291 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  32.06 
 
 
287 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  30.61 
 
 
280 aa  135  1e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  29.67 
 
 
279 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  35.68 
 
 
344 aa  125  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  31.75 
 
 
342 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  30.24 
 
 
267 aa  111  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  32.74 
 
 
260 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  29.88 
 
 
312 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 
260 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  30.22 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  30.22 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  31.34 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  29.33 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  27.73 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  32.16 
 
 
277 aa  85.1  1e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  30.12 
 
 
303 aa  80.5  3e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  28.64 
 
 
283 aa  67.4  2e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  35.84 
 
 
248 aa  65.1  1e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  33.78 
 
 
206 aa  57.4  3e-07  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  29.67 
 
 
222 aa  52  1e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  25.43 
 
 
282 aa  50.8  2e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  26.96 
 
 
208 aa  51.2  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  30.14 
 
 
193 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  22.97 
 
 
197 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.46035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  25.12 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  25.17 
 
 
216 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  22.29 
 
 
196 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  29.06 
 
 
425 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  27.36 
 
 
221 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>