More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0036 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0036  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
272 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0967142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0037  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  99.26 
 
 
272 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0171  ATPase  90.07 
 
 
272 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3309  hypothetical protein  86.4 
 
 
272 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00793915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  85.24 
 
 
272 aa  474  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2642  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  78.68 
 
 
272 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1102  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.97 
 
 
281 aa  337  1e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.86062e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3634  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.97 
 
 
340 aa  312  3e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  26.79 
 
 
350 aa  67.4  2e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.41 
 
 
302 aa  64.7  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  28.71 
 
 
264 aa  63.5  3e-09  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  33.63 
 
 
270 aa  63.2  4e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.64 
 
 
326 aa  61.6  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.97 
 
 
334 aa  62  1e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  25.84 
 
 
350 aa  61.2  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.52 
 
 
334 aa  60.5  3e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  28.29 
 
 
340 aa  60.1  4e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.05 
 
 
302 aa  60.1  4e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.62 
 
 
372 aa  59.7  5e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  3.72935e-08 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  26.6 
 
 
313 aa  59.3  6e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.5 
 
 
313 aa  59.3  7e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  27.87 
 
 
318 aa  59.3  7e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  25.63 
 
 
302 aa  58.9  9e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  27.03 
 
 
309 aa  58.9  9e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  4.6022e-07 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  28.15 
 
 
302 aa  58.5  1e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  29.33 
 
 
315 aa  58.5  1e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  32.24 
 
 
303 aa  58.2  1e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.05 
 
 
362 aa  58.2  1e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.942326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  35.59 
 
 
260 aa  58.5  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  29.52 
 
 
268 aa  58.2  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  30.13 
 
 
260 aa  58.2  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  31.25 
 
 
321 aa  57.8  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.07 
 
 
351 aa  57.8  2e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.72 
 
 
295 aa  57.4  2e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.62 
 
 
320 aa  57.4  3e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  30.2 
 
 
314 aa  57  3e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  33.9 
 
 
260 aa  57.4  3e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  26.2 
 
 
309 aa  57  3e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  29.57 
 
 
260 aa  57.4  3e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  30.27 
 
 
333 aa  56.6  4e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 
327 aa  57  4e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  29.12 
 
 
333 aa  56.6  5e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  27.5 
 
 
337 aa  56.2  5e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  29.87 
 
 
298 aa  56.2  6e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.37 
 
 
266 aa  56.2  6e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.27 
 
 
343 aa  56.2  6e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  27.1 
 
 
331 aa  56.2  6e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.67 
 
 
308 aa  56.2  6e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  28.74 
 
 
303 aa  55.8  7e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  26.23 
 
 
318 aa  55.5  9e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  25.68 
 
 
318 aa  55.5  9e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  32.45 
 
 
306 aa  54.7  1e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  24.66 
 
 
359 aa  55.1  1e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  24.79 
 
 
268 aa  55.5  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  29.14 
 
 
341 aa  55.5  1e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.936381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 
331 aa  55.5  1e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  29.49 
 
 
320 aa  55.1  1e-06  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  28.15 
 
 
313 aa  55.5  1e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  7.89925e-05  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  31.79 
 
 
339 aa  55.1  1e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  26 
 
 
332 aa  54.3  2e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  28.5 
 
 
276 aa  54.3  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  29.95 
 
 
271 aa  54.3  2e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  27.51 
 
 
320 aa  54.3  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.66 
 
 
354 aa  54.7  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  27.32 
 
 
318 aa  54.3  2e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  30.32 
 
 
302 aa  53.9  2e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  24.52 
 
 
263 aa  54.3  2e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  28.48 
 
 
347 aa  53.5  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  31.37 
 
 
332 aa  53.9  3e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  29.68 
 
 
328 aa  53.5  3e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  29.41 
 
 
316 aa  53.9  3e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  30 
 
 
303 aa  53.9  3e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.97 
 
 
327 aa  53.5  4e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.97 
 
 
323 aa  53.1  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  31.68 
 
 
260 aa  53.5  4e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.5 
 
 
271 aa  53.1  4e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  2.22341e-06 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.21 
 
 
342 aa  53.5  4e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3573  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.6 
 
 
340 aa  53.1  5e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.54 
 
 
319 aa  53.1  5e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.32 
 
 
335 aa  53.1  5e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  33.9 
 
 
277 aa  52.8  6e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  25 
 
 
324 aa  52.8  6e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3212  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.62 
 
 
322 aa  52.8  6e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0307569  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.5 
 
 
341 aa  52.8  6e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  25.88 
 
 
265 aa  52.8  6e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  30.26 
 
 
318 aa  52.8  7e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.68 
 
 
349 aa  52.8  7e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  27.55 
 
 
324 aa  52.4  7e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  3.06223e-06  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 
332 aa  52.8  7e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  24.5 
 
 
263 aa  52  9e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  27.18 
 
 
305 aa  52.4  9e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  28.65 
 
 
356 aa  52  9e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  24.5 
 
 
263 aa  52  9e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  30.41 
 
 
318 aa  52  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  26.8 
 
 
323 aa  51.6  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.56 
 
 
325 aa  51.6  1e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.15 
 
 
303 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  23.93 
 
 
321 aa  51.6  1e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  24.26 
 
 
309 aa  51.6  1e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.47 
 
 
267 aa  52  1e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>