107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0030 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 
317 aa  649  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  98.42 
 
 
317 aa  639  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  71.61 
 
 
296 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  68.77 
 
 
296 aa  440  1e-122  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  68.45 
 
 
295 aa  437  1e-122  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  68.45 
 
 
295 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  65.16 
 
 
292 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  42.3 
 
 
285 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  41.29 
 
 
299 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  7.56552e-06 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.24 
 
 
293 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.8 
 
 
462 aa  239  6e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.78 
 
 
284 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.67 
 
 
334 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  46.1 
 
 
283 aa  235  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  41.91 
 
 
326 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  40.38 
 
 
299 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  40.07 
 
 
308 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.98 
 
 
286 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.79 
 
 
294 aa  219  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.01 
 
 
306 aa  216  3e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  37.05 
 
 
281 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.67 
 
 
300 aa  214  2e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.67 
 
 
300 aa  214  2e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  42.31 
 
 
502 aa  214  2e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  213  4e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.07 
 
 
508 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  37.3 
 
 
281 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.72 
 
 
502 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.59 
 
 
497 aa  201  1e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  39.31 
 
 
502 aa  201  2e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  34.08 
 
 
349 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.85 
 
 
288 aa  195  8e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.96629e-07 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.26 
 
 
281 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.46 
 
 
300 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.74 
 
 
295 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.35 
 
 
294 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.71 
 
 
294 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.29 
 
 
295 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.86 
 
 
305 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.01 
 
 
290 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.65 
 
 
282 aa  173  3e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  34.06 
 
 
303 aa  172  6e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.06 
 
 
303 aa  172  6e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  3.77327e-10 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.69 
 
 
302 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.03 
 
 
302 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  31.65 
 
 
301 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.81 
 
 
303 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  31 
 
 
290 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.59 
 
 
301 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.08 
 
 
296 aa  164  1e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.13 
 
 
303 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.89 
 
 
290 aa  162  8e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  30.91 
 
 
301 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  31.72 
 
 
296 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.53 
 
 
297 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.8 
 
 
297 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.29 
 
 
276 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.17 
 
 
297 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  32.14 
 
 
297 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.31 
 
 
305 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.23 
 
 
320 aa  155  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  32.32 
 
 
296 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.19 
 
 
306 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  32.88 
 
 
303 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.65 
 
 
291 aa  147  2e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  30.1 
 
 
285 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  30.1 
 
 
285 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  29.13 
 
 
293 aa  142  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  29.77 
 
 
285 aa  137  3e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.25 
 
 
296 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.53 
 
 
300 aa  135  6e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  29.63 
 
 
282 aa  134  2e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.24 
 
 
293 aa  132  7e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.6 
 
 
293 aa  131  1e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  26.6 
 
 
293 aa  131  1e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  26.6 
 
 
293 aa  131  2e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0624  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.6 
 
 
300 aa  129  5e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.022325  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.42 
 
 
282 aa  129  8e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0428  succinate dehydrogenase subunit C  26.11 
 
 
295 aa  128  1e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28 
 
 
282 aa  128  2e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.7 
 
 
282 aa  126  4e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  27.76 
 
 
282 aa  126  4e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  29.52 
 
 
296 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0240  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  30.53 
 
 
308 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.345806 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.15 
 
 
300 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.47 
 
 
299 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  26.03 
 
 
300 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  28.33 
 
 
282 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0639  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  29.19 
 
 
300 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0589  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.71 
 
 
307 aa  120  2e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.0373464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.42 
 
 
282 aa  119  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  28 
 
 
282 aa  118  2e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.56 
 
 
304 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1435  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.64 
 
 
278 aa  112  1e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0440  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  28.9 
 
 
292 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  27.61 
 
 
306 aa  108  8e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00419351  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.35 
 
 
297 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1954  heterodisulfide reductase, subunit B  22.37 
 
 
314 aa  71.2  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1698  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.32 
 
 
348 aa  61.6  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11757e-05 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  25.18 
 
 
730 aa  52  1e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>