47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0023 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  354  4e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  68.26 
 
 
180 aa  237  6e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.10374e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  61.76 
 
 
175 aa  219  2e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  62.72 
 
 
172 aa  216  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  60.47 
 
 
174 aa  205  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  61.29 
 
 
172 aa  204  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  47.62 
 
 
190 aa  160  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  51.32 
 
 
177 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  46.25 
 
 
207 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  2.27371e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  44.51 
 
 
197 aa  147  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  1.00693e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  45.73 
 
 
194 aa  146  1e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  38.27 
 
 
209 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  5.16756e-07  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  42.42 
 
 
187 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  32.8 
 
 
204 aa  91.7  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  38.12 
 
 
212 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  35.14 
 
 
223 aa  78.6  4e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  33.9 
 
 
208 aa  76.6  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  33.12 
 
 
215 aa  77  1e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  30.77 
 
 
298 aa  76.6  2e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  31.93 
 
 
303 aa  76.3  2e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  28.22 
 
 
193 aa  74.7  6e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.35216e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  32.5 
 
 
204 aa  72.8  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  30.86 
 
 
233 aa  72.4  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2345  hypothetical protein  51.67 
 
 
98 aa  72  4e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.938426  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  31.17 
 
 
224 aa  71.2  7e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  32.94 
 
 
232 aa  70.5  1e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  9.26044e-10 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  68.9  3e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  35.03 
 
 
197 aa  68.9  4e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  26.47 
 
 
240 aa  68.6  4e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  31.65 
 
 
207 aa  68.6  5e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  30.57 
 
 
200 aa  67.4  1e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  30.12 
 
 
205 aa  67  1e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  32.52 
 
 
191 aa  65.9  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  32.28 
 
 
209 aa  66.2  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  26.79 
 
 
247 aa  65.1  4e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  30.34 
 
 
245 aa  65.5  4e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  32.05 
 
 
192 aa  64.3  7e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  32.05 
 
 
192 aa  64.3  7e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  32.05 
 
 
192 aa  64.3  7e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  29.76 
 
 
196 aa  63.9  9e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  28.43 
 
 
248 aa  60.8  9e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  31.46 
 
 
254 aa  60.5  1e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  31.71 
 
 
227 aa  57.4  9e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2180  hypothetical protein  35.22 
 
 
208 aa  56.6  2e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  36.78 
 
 
180 aa  55.1  5e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  28.85 
 
 
211 aa  53.5  1e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  31.25 
 
 
266 aa  52.8  2e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>