More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0020 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  74.84 
 
 
471 aa  731  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.46466e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  98.93 
 
 
469 aa  944  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  75.37 
 
 
469 aa  710  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  73.5 
 
 
470 aa  700  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  100 
 
 
469 aa  952  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  71.09 
 
 
470 aa  679  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.5302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.78 
 
 
464 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.9955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  55.79 
 
 
476 aa  507  1e-142  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  54.89 
 
 
482 aa  507  1e-142  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  54.35 
 
 
464 aa  504  1e-142  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  55.11 
 
 
482 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.23 
 
 
465 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  55.56 
 
 
483 aa  501  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  55.75 
 
 
462 aa  498  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76272e-07 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  53.8 
 
 
465 aa  495  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  54.01 
 
 
465 aa  494  1e-138  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  53.93 
 
 
477 aa  493  1e-138  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  52.98 
 
 
480 aa  493  1e-138  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  57.89 
 
 
469 aa  493  1e-138  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  52.75 
 
 
480 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.39 
 
 
466 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  52.13 
 
 
503 aa  478  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  54.64 
 
 
468 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.61 
 
 
463 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.37 
 
 
467 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.29 
 
 
469 aa  478  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.87651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  54.07 
 
 
455 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.04 
 
 
466 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  55.92 
 
 
469 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  54.33 
 
 
468 aa  473  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  54.55 
 
 
468 aa  472  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.77 
 
 
497 aa  471  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  53.93 
 
 
1005 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.43 
 
 
464 aa  468  1e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.78 
 
 
467 aa  468  1e-130  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.52 
 
 
457 aa  466  1e-130  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  52.94 
 
 
468 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  53.91 
 
 
1008 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.63 
 
 
761 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  55.14 
 
 
463 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.09 
 
 
479 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  52.72 
 
 
468 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  53.48 
 
 
1011 aa  460  1e-128  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.67 
 
 
474 aa  461  1e-128  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.39676e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  52.22 
 
 
994 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.08 
 
 
458 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  53.48 
 
 
1011 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.53 
 
 
466 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  55.75 
 
 
476 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  53.29 
 
 
476 aa  454  1e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  7.13283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  53.59 
 
 
446 aa  454  1e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.96 
 
 
465 aa  449  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  54.47 
 
 
459 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.87 
 
 
447 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.32 
 
 
463 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.33 
 
 
480 aa  447  1e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.56 
 
 
461 aa  448  1e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  6.64223e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.07 
 
 
469 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  52.39 
 
 
747 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.44 
 
 
448 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  54.27 
 
 
994 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.11 
 
 
476 aa  436  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  53.52 
 
 
476 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  51.61 
 
 
473 aa  417  1e-115  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  48.98 
 
 
447 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  52.6 
 
 
481 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  50.11 
 
 
477 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  49.47 
 
 
473 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.03 
 
 
483 aa  337  3e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  4.97626e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.07 
 
 
944 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  42.41 
 
 
942 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  42.62 
 
 
944 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  42.86 
 
 
944 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  41.67 
 
 
947 aa  323  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.14 
 
 
465 aa  319  9e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  8.58078e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.65 
 
 
438 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.91225e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  44.17 
 
 
1150 aa  314  2e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  41.36 
 
 
465 aa  314  2e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  40.9 
 
 
462 aa  310  3e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  38.49 
 
 
472 aa  305  9e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  38.49 
 
 
472 aa  305  9e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  37.69 
 
 
470 aa  304  3e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  38.28 
 
 
472 aa  303  3e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  43.54 
 
 
493 aa  303  5e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.53 
 
 
674 aa  303  5e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  38.16 
 
 
469 aa  303  6e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.61 
 
 
658 aa  302  8e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.92 
 
 
445 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  40.63 
 
 
440 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.98 
 
 
667 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  38.45 
 
 
468 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  38.45 
 
 
468 aa  299  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  38.66 
 
 
468 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.51 
 
 
996 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  38.24 
 
 
468 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  37.85 
 
 
472 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  37.63 
 
 
472 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  37.63 
 
 
472 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  38.06 
 
 
472 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  37.63 
 
 
472 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>