More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0012 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  98.05 
 
 
308 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  72.4 
 
 
308 aa  474  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  67.21 
 
 
308 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  68.51 
 
 
308 aa  445  1e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  59.93 
 
 
308 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.37 
 
 
328 aa  262  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.91 
 
 
325 aa  255  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.47 
 
 
322 aa  254  2e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 
333 aa  253  4e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.13 
 
 
328 aa  251  9e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 
327 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.36 
 
 
330 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  47.02 
 
 
329 aa  246  5e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 
279 aa  245  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 
339 aa  245  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.95 
 
 
327 aa  245  6e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.74362e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
330 aa  245  8e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.34 
 
 
316 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.51 
 
 
316 aa  243  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.95 
 
 
327 aa  243  4e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.29 
 
 
324 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  42.53 
 
 
330 aa  242  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 
345 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.44 
 
 
343 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.75 
 
 
323 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 
328 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  42.21 
 
 
316 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  49.81 
 
 
309 aa  240  3e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.97 
 
 
324 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.9 
 
 
329 aa  238  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
323 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 
329 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.47 
 
 
326 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
334 aa  236  5e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
279 aa  235  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.27 
 
 
324 aa  233  2e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 
338 aa  234  2e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 
334 aa  233  4e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  45.42 
 
 
325 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 
325 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.98 
 
 
324 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 
333 aa  229  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.3 
 
 
326 aa  228  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 
323 aa  228  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 
320 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 
316 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
325 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  6.47943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.63 
 
 
323 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.42 
 
 
348 aa  222  5e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.12 
 
 
321 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
266 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  38.44 
 
 
310 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
374 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
311 aa  216  3e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  36.56 
 
 
320 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.94 
 
 
319 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 
331 aa  214  1e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
322 aa  214  2e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.82 
 
 
337 aa  214  2e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 
446 aa  214  2e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.13 
 
 
282 aa  214  2e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.39 
 
 
332 aa  213  3e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
334 aa  213  4e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.37 
 
 
338 aa  213  4e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.27 
 
 
321 aa  212  6e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 
334 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
366 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
316 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
366 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.35 
 
 
330 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 
353 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.26 
 
 
366 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.72 
 
 
324 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.34 
 
 
338 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.32 
 
 
312 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
307 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.54 
 
 
317 aa  209  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.92 
 
 
317 aa  208  7e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.94 
 
 
326 aa  208  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  35.42 
 
 
338 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
334 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.21 
 
 
325 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1377e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.85 
 
 
339 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 
321 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.67 
 
 
342 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
345 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.85 
 
 
339 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
312 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
312 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
312 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  39.22 
 
 
323 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
316 aa  206  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0617  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
329 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899529  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.48 
 
 
314 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
312 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  40.78 
 
 
339 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51275e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
312 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
312 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  40.07 
 
 
314 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>