More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0009 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  95.87 
 
 
511 aa  980  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
509 aa  1023  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.14 
 
 
508 aa  677  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  61.76 
 
 
516 aa  613  1e-174  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.79 
 
 
508 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 
392 aa  235  1e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
503 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
719 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
711 aa  209  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
726 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0871  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
358 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
677 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
498 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
880 aa  180  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
542 aa  180  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
1287 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  38.43 
 
 
461 aa  176  1e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
505 aa  175  2e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
556 aa  174  4e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
905 aa  173  7e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  40.23 
 
 
461 aa  173  7e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  40.23 
 
 
461 aa  173  8e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
561 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
911 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
1691 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
680 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
531 aa  170  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
958 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
520 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
556 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  36.69 
 
 
1111 aa  166  1e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
489 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
637 aa  163  5e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
933 aa  163  8e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
722 aa  163  8e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  1.04285e-09 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  35.66 
 
 
464 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
701 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
944 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
718 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
815 aa  160  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
884 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
571 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
1039 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.91257e-05 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
634 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
827 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  27.05 
 
 
581 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
667 aa  157  5e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
885 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
589 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
1319 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
893 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
592 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
612 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
899 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
546 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 
611 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  28.08 
 
 
762 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
581 aa  153  6e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
499 aa  153  6e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  26.02 
 
 
484 aa  153  6e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
1017 aa  153  6e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
906 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
458 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  27.51 
 
 
581 aa  153  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 
916 aa  153  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
1042 aa  153  9e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1064 aa  152  9e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
396 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
763 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
899 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
695 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 
619 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
680 aa  151  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
621 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  26.45 
 
 
613 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.19997e-07  hitchhiker  9.90225e-13 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  28.69 
 
 
595 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
718 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
588 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
610 aa  150  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
1014 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1977 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.96 
 
 
510 aa  150  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
488 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
582 aa  149  1e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
2161 aa  149  1e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
581 aa  149  1e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1002 aa  149  1e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
660 aa  149  1e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 
1118 aa  148  2e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
2783 aa  148  2e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
593 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
1043 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
567 aa  147  4e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
1174 aa  147  4e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.15 
 
 
617 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
748 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
674 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
1211 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  27.85 
 
 
595 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
556 aa  146  8e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>