More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_5506 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  99.67 
 
 
303 aa  624  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  100 
 
 
303 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  98.02 
 
 
303 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  90.1 
 
 
302 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  88.82 
 
 
304 aa  547  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  88.12 
 
 
302 aa  530  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  83.17 
 
 
299 aa  518  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  85.48 
 
 
302 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  73.03 
 
 
304 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  73.03 
 
 
304 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  55.3 
 
 
313 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  53.69 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  40.52 
 
 
316 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  40 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  39.67 
 
 
374 aa  205  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  38.08 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.05 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.19 
 
 
338 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  37.09 
 
 
338 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  37.75 
 
 
334 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  37.95 
 
 
338 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.39 
 
 
335 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  36.75 
 
 
337 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  37.95 
 
 
338 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.38 
 
 
383 aa  188  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  38.29 
 
 
333 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
337 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  38.29 
 
 
333 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  38.29 
 
 
333 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  38.29 
 
 
333 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  36.91 
 
 
338 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  36.91 
 
 
337 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
337 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
335 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  36.91 
 
 
333 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.38 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  38.22 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  38.22 
 
 
333 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  37.7 
 
 
333 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.71 
 
 
333 aa  182  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.11 
 
 
317 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  37.06 
 
 
333 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  37.09 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  36.73 
 
 
377 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  38.55 
 
 
372 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  38.55 
 
 
374 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  39.66 
 
 
375 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  33.22 
 
 
435 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  39.66 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  39.66 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.16 
 
 
488 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  34.15 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  35.71 
 
 
427 aa  170  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 
374 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.66 
 
 
322 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  33.92 
 
 
410 aa  168  9e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  33.11 
 
 
296 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  37.06 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  36.42 
 
 
399 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.37 
 
 
329 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  36.73 
 
 
400 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  36.11 
 
 
399 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
398 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  36.17 
 
 
386 aa  162  9e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  35.91 
 
 
400 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.56 
 
 
345 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.91 
 
 
401 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  35.29 
 
 
398 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
398 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  35.29 
 
 
398 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  35.29 
 
 
398 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  34.06 
 
 
345 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  34.06 
 
 
345 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  34.06 
 
 
345 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.49 
 
 
388 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  34.17 
 
 
345 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  34.06 
 
 
345 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  34.66 
 
 
345 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  35.92 
 
 
320 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  34.66 
 
 
345 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  34.89 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  34.89 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0211  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.55 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.22 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.9 
 
 
308 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.13 
 
 
349 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  33.87 
 
 
412 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  34.85 
 
 
405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  34.85 
 
 
405 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.14 
 
 
475 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.08 
 
 
362 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.07 
 
 
445 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  29.6 
 
 
450 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.47 
 
 
418 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.92 
 
 
495 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>