More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_4263 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4111  sensory box/GGDEF family protein, putative  100 
 
 
430 aa  885    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4153  putative sensory box/GGDEF family protein  93.01 
 
 
430 aa  828    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3954  sensory box/GGDEF family protein  100 
 
 
431 aa  886    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3785  sensory box/GGDEF family protein  99.53 
 
 
431 aa  882    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3800  sensory box/GGDEF family protein  99.77 
 
 
431 aa  885    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0221299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4064  putative sensory box/GGDEF family protein  100 
 
 
431 aa  886    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3873  diguanylate cyclase  90.44 
 
 
430 aa  813    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4263  sensory box/GGDEF family protein  100 
 
 
430 aa  885    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2743  diguanylate cyclase  74.59 
 
 
431 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.241398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1085  putative sensory box/GGDEF family protein  92.54 
 
 
430 aa  828    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4175  putative sensory box/GGDEF family protein  100 
 
 
430 aa  885    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00125122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.09 
 
 
476 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  42.08 
 
 
659 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  35.2 
 
 
768 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  42.86 
 
 
689 aa  146  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.76 
 
 
438 aa  146  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  31.31 
 
 
539 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1844  diguanylate cyclase  44.91 
 
 
456 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674113  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0312  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.76 
 
 
454 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  44.31 
 
 
738 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  41.99 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  42.26 
 
 
753 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.38 
 
 
419 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  29.86 
 
 
555 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.95 
 
 
424 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  43.48 
 
 
736 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  39.77 
 
 
366 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  42.01 
 
 
432 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.77 
 
 
550 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  40.68 
 
 
227 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.81 
 
 
669 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.45 
 
 
772 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  42.07 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.67 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3523  diguanylate cyclase  42.94 
 
 
452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1336  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
439 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0220322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  39.55 
 
 
334 aa  133  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  41.88 
 
 
492 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.01 
 
 
796 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  39.05 
 
 
714 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.44 
 
 
646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  39.55 
 
 
634 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1579  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.31 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  40 
 
 
432 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  40.94 
 
 
556 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2110  PAS:GGDEF  33.19 
 
 
796 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172113  normal  0.0218284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  39.63 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4405  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.75 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.382822 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  41.36 
 
 
611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  36.1 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  33.81 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.41 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  35.52 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  38.76 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0431  hypothetical protein  41.98 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  41.1 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  40.96 
 
 
758 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1868  diguanylate cyclase  41.67 
 
 
301 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3966  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.75 
 
 
332 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756589  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1449  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.75 
 
 
332 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5471  sensory box/GGDEF family protein  37.38 
 
 
814 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00599956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.05 
 
 
686 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
202 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  41.67 
 
 
485 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04420  hypothetical protein  42.59 
 
 
376 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.05 
 
 
1072 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  39.87 
 
 
458 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1323  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.59 
 
 
441 aa  126  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  41.42 
 
 
477 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  39.05 
 
 
482 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0021  diguanylate cyclase  42.24 
 
 
423 aa  126  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  42.29 
 
 
237 aa  126  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  35.44 
 
 
387 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1767  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.97 
 
 
716 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00167565  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1953  diguanylate cyclase  41.1 
 
 
454 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.363504  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  40 
 
 
474 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5481  sensory box/GGDEF family protein  37.38 
 
 
735 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242915  hitchhiker  1.94028e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2357  diguanylate cyclase  40.85 
 
 
252 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.55 
 
 
557 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  39.51 
 
 
493 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.11 
 
 
309 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3370  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.11 
 
 
860 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.742202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  38.46 
 
 
482 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  31.82 
 
 
451 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2313  sensory box/GGDEF domain protein  35.23 
 
 
323 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.56 
 
 
564 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  38.8 
 
 
565 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.84 
 
 
796 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.84 
 
 
800 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  41.03 
 
 
418 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  39.26 
 
 
661 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  40.12 
 
 
455 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  44.51 
 
 
443 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  38.65 
 
 
498 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  39.88 
 
 
485 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  36.77 
 
 
1076 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
336 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2370  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
554 aa  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
485 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>