More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_3971 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  57.06 
 
 
697 aa  816  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  1.08626e-08 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  45.01 
 
 
831 aa  651  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  72.82 
 
 
691 aa  1024  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  55.68 
 
 
693 aa  812  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  97.4 
 
 
692 aa  1368  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  53.26 
 
 
694 aa  759  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  51.94 
 
 
690 aa  721  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  48.09 
 
 
793 aa  646  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  61.45 
 
 
708 aa  872  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  53.98 
 
 
669 aa  741  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  54.64 
 
 
700 aa  763  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  54.64 
 
 
700 aa  759  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  45.27 
 
 
831 aa  656  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  45.01 
 
 
831 aa  651  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  55.43 
 
 
706 aa  749  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  46.03 
 
 
758 aa  648  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  8.37338e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  56.67 
 
 
695 aa  801  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  47.66 
 
 
853 aa  660  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  46.28 
 
 
894 aa  667  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  55.06 
 
 
691 aa  778  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  56.62 
 
 
711 aa  800  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  59.91 
 
 
693 aa  872  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  58.72 
 
 
694 aa  801  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  74.96 
 
 
691 aa  1092  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53126e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  56.85 
 
 
702 aa  806  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  46.34 
 
 
813 aa  663  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  93.5 
 
 
692 aa  1308  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.95417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  60.15 
 
 
710 aa  864  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  66.28 
 
 
691 aa  961  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  46.6 
 
 
789 aa  646  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  61.19 
 
 
706 aa  881  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.94767e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  66.28 
 
 
691 aa  961  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  46.29 
 
 
836 aa  650  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  2.44427e-09 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  48.27 
 
 
684 aa  700  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  61.14 
 
 
714 aa  860  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  50.44 
 
 
686 aa  701  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  44.2 
 
 
767 aa  637  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  52.92 
 
 
693 aa  742  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  45.82 
 
 
776 aa  664  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  6.97651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  45.55 
 
 
756 aa  657  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.24271e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  58.1 
 
 
697 aa  843  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  62.17 
 
 
696 aa  900  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  45.51 
 
 
758 aa  642  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.50772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  47.81 
 
 
703 aa  653  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  54.26 
 
 
711 aa  780  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  99.28 
 
 
692 aa  1422  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  99.42 
 
 
692 aa  1424  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  62.7 
 
 
706 aa  885  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  66.86 
 
 
689 aa  978  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  43.14 
 
 
758 aa  638  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  51.37 
 
 
715 aa  683  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  46.03 
 
 
758 aa  665  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.70299e-09  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  99.42 
 
 
692 aa  1424  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.21974e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  47.28 
 
 
703 aa  658  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  99.13 
 
 
692 aa  1420  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.76522e-06  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  45.35 
 
 
841 aa  650  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  48.58 
 
 
696 aa  640  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  100 
 
 
692 aa  1431  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  100 
 
 
692 aa  1431  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.71341e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  99.86 
 
 
692 aa  1431  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.6995e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  100 
 
 
692 aa  1431  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.27033e-60 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  47.51 
 
 
703 aa  664  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  45.9 
 
 
757 aa  655  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  100 
 
 
692 aa  1431  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  54.55 
 
 
696 aa  793  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.89001e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  43.18 
 
 
760 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  43.78 
 
 
765 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  46.86 
 
 
859 aa  633  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  45.47 
 
 
751 aa  634  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  44.84 
 
 
759 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  44.43 
 
 
779 aa  635  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  44.58 
 
 
759 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  43.65 
 
 
765 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  4.3689e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  45.47 
 
 
748 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  3.72801e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  44.05 
 
 
779 aa  632  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.91579e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  44.26 
 
 
768 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  43.82 
 
 
851 aa  628  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  43.82 
 
 
851 aa  628  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  43.08 
 
 
783 aa  626  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  49.78 
 
 
721 aa  625  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  43.16 
 
 
747 aa  621  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  46.71 
 
 
780 aa  621  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.73362e-05  unclonable  4.69192e-08 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  43.54 
 
 
746 aa  613  1e-174  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  45.98 
 
 
708 aa  611  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.22971e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  44.37 
 
 
695 aa  607  1e-172  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  43.47 
 
 
702 aa  604  1e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  43.3 
 
 
836 aa  605  1e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  43.53 
 
 
704 aa  603  1e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  43.16 
 
 
700 aa  603  1e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  43.02 
 
 
700 aa  603  1e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  44.19 
 
 
694 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 
700 aa  601  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  44.27 
 
 
798 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  43.96 
 
 
802 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  43.71 
 
 
694 aa  583  1e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 
798 aa  581  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  44.04 
 
 
804 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  43.4 
 
 
798 aa  577  1e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  43.45 
 
 
689 aa  578  1e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  42.4 
 
 
799 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>