63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_3915 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_3520  recA protein (recombinase A), C-terminal region  99.77 
 
 
426 bp  837    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000187818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  89.75 
 
 
1032 bp  708    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  94.21 
 
 
1032 bp  922    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3826  recA protein, group I intron-containing  98.36 
 
 
426 bp  789    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3915    100 
 
 
1359 bp  2694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000162036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  96.97 
 
 
627 bp  1092    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  98.88 
 
 
627 bp  1187    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3538  recA protein (recombinase A), C-terminal region  99.77 
 
 
426 bp  837    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000279378  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  100 
 
 
627 bp  1243    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  100 
 
 
1542 bp  2694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  95.07 
 
 
1032 bp  967    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  93.91 
 
 
1032 bp  912    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3791  recA protein, group I intron-containing  100 
 
 
426 bp  844    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000289206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  98.38 
 
 
1359 bp  2520    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  99.84 
 
 
627 bp  1239    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  82.59 
 
 
1044 bp  149  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  82.59 
 
 
1044 bp  149  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1190  recA protein  83.17 
 
 
852 bp  135  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000832265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  82.86 
 
 
1089 bp  87.7  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2083  recA protein  79.82 
 
 
834 bp  83.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  82.14 
 
 
1044 bp  79.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  81.43 
 
 
1026 bp  71.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  95.35 
 
 
1095 bp  69.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  92 
 
 
1014 bp  67.9  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  82.24 
 
 
1050 bp  61.9  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  90.2 
 
 
1044 bp  61.9  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  94.74 
 
 
1032 bp  60  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  94.74 
 
 
1035 bp  60  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  90 
 
 
1014 bp  60  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  86.15 
 
 
1131 bp  58  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1120  recA protein  84.93 
 
 
1047 bp  58  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  85.29 
 
 
1158 bp  56  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  92.5 
 
 
1098 bp  56  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  94.44 
 
 
1044 bp  56  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  94.44 
 
 
1044 bp  56  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  90.91 
 
 
1050 bp  56  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0081  recombinase A  90.7 
 
 
1107 bp  54  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.449837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  94.29 
 
 
1164 bp  54  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  92.31 
 
 
1032 bp  54  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  85.48 
 
 
1077 bp  52  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  92.11 
 
 
1095 bp  52  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  90.48 
 
 
1014 bp  52  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  84.29 
 
 
1059 bp  52  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  94.12 
 
 
1092 bp  52  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  83.78 
 
 
1095 bp  52  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  88 
 
 
1140 bp  52  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  84.29 
 
 
1038 bp  52  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  90.24 
 
 
1011 bp  50.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  90.24 
 
 
1050 bp  50.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  90.24 
 
 
1044 bp  50.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  86.79 
 
 
1140 bp  50.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  90.24 
 
 
1050 bp  50.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  96.55 
 
 
1065 bp  50.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  82.72 
 
 
1095 bp  50.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  91.89 
 
 
1047 bp  50.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  81.44 
 
 
1083 bp  50.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  81.52 
 
 
1080 bp  48.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  93.75 
 
 
1032 bp  48.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  96.43 
 
 
1041 bp  48.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  88.64 
 
 
1020 bp  48.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  88.64 
 
 
1068 bp  48.1  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  93.75 
 
 
1059 bp  48.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  88.64 
 
 
1023 bp  48.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>