123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_3593 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3332  exonuclease  100 
 
 
281 aa  497  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  99.17 
 
 
281 aa  494  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  99.17 
 
 
281 aa  494  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  100 
 
 
242 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  98.76 
 
 
281 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  95.42 
 
 
281 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  94.58 
 
 
281 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  88.02 
 
 
281 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  88.75 
 
 
281 aa  441  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  88.75 
 
 
281 aa  440  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.38 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  29.53 
 
 
300 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  28.26 
 
 
574 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.63 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  28.86 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.26 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  32.52 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  30.22 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.71 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.78 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  29.41 
 
 
578 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  29.1 
 
 
719 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  26.32 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.3 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  30.22 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  30.22 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  28.78 
 
 
207 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  28.78 
 
 
207 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.03 
 
 
605 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  30.71 
 
 
207 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  25.38 
 
 
282 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  27.46 
 
 
222 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.93 
 
 
183 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.74 
 
 
595 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.89 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 
574 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  27.61 
 
 
570 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.28 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  32 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.34 
 
 
1442 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.61 
 
 
1367 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  27.38 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  26.95 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.61 
 
 
1367 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  29.5 
 
 
183 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  29.5 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  29.5 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.99 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  29.5 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  26.81 
 
 
183 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.17 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  29.5 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  25.9 
 
 
585 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2197  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.26 
 
 
205 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519695  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  28.87 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4910  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.43 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0387516  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.99 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.99 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.49 
 
 
944 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2460  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.99 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275713  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.06 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  26.81 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2007  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5458  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.43 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.99 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  25.36 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  27.97 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.64 
 
 
609 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  26.15 
 
 
176 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  26.67 
 
 
613 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  28.93 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.52 
 
 
565 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6094  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.84 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0666129  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  25 
 
 
1464 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1983  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.84 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  25.37 
 
 
584 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  25.36 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5296  DNA-directed DNA polymerase  24.84 
 
 
205 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0646344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  25.18 
 
 
607 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  27.27 
 
 
1468 aa  46.2  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.57 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  31.34 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  26.62 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  29.24 
 
 
1635 aa  45.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  24.46 
 
 
192 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.82 
 
 
226 aa  45.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  23.7 
 
 
1449 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1529  DNA polymerase III, epsilon subunit related 3'-5' exonuclease  22.79 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.66 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  30.94 
 
 
1390 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  28.1 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  26.76 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1834  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.41 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.600995  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  23.7 
 
 
1449 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>