More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_2388 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  94.05 
 
 
640 aa  1252    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
635 aa  723    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
635 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
636 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
640 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
635 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  51.25 
 
 
645 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
638 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
635 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  95.14 
 
 
640 aa  1265    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
645 aa  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
635 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
640 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
647 aa  640    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
645 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 
639 aa  740    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
640 aa  677    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
639 aa  1319    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
645 aa  731    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  99.22 
 
 
639 aa  1310    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
645 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  97.5 
 
 
639 aa  1288    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
645 aa  731    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
635 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
588 aa  643    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
637 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
645 aa  725    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
644 aa  738    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.56 
 
 
638 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
641 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
635 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
635 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
637 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
635 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
636 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
635 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
640 aa  738    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 
643 aa  732    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  95.46 
 
 
640 aa  1268    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
638 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
635 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
638 aa  690    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
635 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
645 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
644 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
642 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
639 aa  1319    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
645 aa  731    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
635 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
644 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
646 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
634 aa  752    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
633 aa  728    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
635 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
645 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
635 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
639 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 
635 aa  756    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
645 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
635 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
669 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
636 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
645 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
635 aa  668    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
644 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 
635 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
636 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 
636 aa  704    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
638 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
644 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  99.22 
 
 
639 aa  1310    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
635 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  81.35 
 
 
640 aa  1110    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
640 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 
635 aa  777    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
635 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
639 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 
635 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  96.09 
 
 
639 aa  1276    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
642 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
645 aa  729    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
635 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
645 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
640 aa  688    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
635 aa  734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
643 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
635 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  91.86 
 
 
639 aa  1233    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
635 aa  723    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
644 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
648 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
635 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
644 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
648 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
645 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
636 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
636 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
635 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
640 aa  738    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>