More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_1271 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  100 
 
 
80 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  100 
 
 
69 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  100 
 
 
65 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  98.39 
 
 
71 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  64.41 
 
 
62 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  57.63 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 
63 aa  76.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  63.46 
 
 
66 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  62.96 
 
 
69 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  55.93 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  63.64 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  62.96 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  57.89 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  59.26 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  60.71 
 
 
73 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 
63 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 
65 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  61.11 
 
 
64 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  54.24 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  65.38 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  54.39 
 
 
67 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  56.14 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  58.06 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  61.54 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  57.14 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  54.39 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  57.14 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  57.14 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  53.57 
 
 
63 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  57.14 
 
 
72 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  54.1 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  56.25 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  57.14 
 
 
72 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  55.56 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  51.72 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  51.72 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  55.56 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  51.72 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  55.56 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  53.33 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  56.36 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  51.72 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  57.89 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  53.45 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  54.24 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 
63 aa  67  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  56.14 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  57.89 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  53.23 
 
 
68 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  55.36 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  65.22 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  46.67 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  53.33 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  57.41 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  61.02 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  53.57 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  61.54 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  52.54 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  52.54 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  52.54 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  52.54 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  52.54 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  49.15 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  53.7 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>