More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_0005 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  59.49 
 
 
804 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  59.49 
 
 
804 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  52.84 
 
 
804 aa  644    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  55.15 
 
 
642 aa  707    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  60.75 
 
 
795 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 
655 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  55.49 
 
 
654 aa  726    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  58.22 
 
 
638 aa  741    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  54.06 
 
 
666 aa  682    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  70.62 
 
 
643 aa  890    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  56.27 
 
 
804 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  99.84 
 
 
640 aa  1315    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  56.14 
 
 
654 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 
655 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  66.41 
 
 
650 aa  863    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  52.31 
 
 
653 aa  672    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  55.15 
 
 
642 aa  704    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  55.5 
 
 
655 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
640 aa  1315    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  55.99 
 
 
654 aa  707    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
640 aa  1315    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  56.14 
 
 
654 aa  708    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  55.35 
 
 
635 aa  733    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  52.36 
 
 
647 aa  643    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  98.44 
 
 
640 aa  1295    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  56.14 
 
 
654 aa  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  68.49 
 
 
638 aa  875    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  56.72 
 
 
805 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  56.89 
 
 
805 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 
655 aa  699    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  57.67 
 
 
661 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  55.66 
 
 
655 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  62.71 
 
 
633 aa  792    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  58.1 
 
 
645 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.21 
 
 
656 aa  681    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  57.71 
 
 
807 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  55.28 
 
 
651 aa  694    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.5 
 
 
795 aa  683    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  58.5 
 
 
644 aa  747    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 
655 aa  727    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  58.13 
 
 
637 aa  748    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  56.59 
 
 
655 aa  736    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  60.43 
 
 
795 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
714 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  70.19 
 
 
640 aa  872    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
640 aa  1315    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  55.99 
 
 
654 aa  707    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  58.8 
 
 
627 aa  721    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  54.89 
 
 
655 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  59.21 
 
 
645 aa  721    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  53.79 
 
 
634 aa  703    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  56.43 
 
 
655 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  64.87 
 
 
634 aa  832    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 
675 aa  693    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  66.1 
 
 
649 aa  851    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  54.66 
 
 
679 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.84 
 
 
675 aa  699    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  55.43 
 
 
719 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  53.92 
 
 
665 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  53.12 
 
 
674 aa  668    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  62.88 
 
 
632 aa  826    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  59.67 
 
 
804 aa  648    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  53.92 
 
 
663 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  53.56 
 
 
646 aa  699    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  51.7 
 
 
675 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 
675 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  59.37 
 
 
644 aa  796    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0004  DNA gyrase, B subunit  57.75 
 
 
806 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  56.14 
 
 
652 aa  737    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  67.14 
 
 
638 aa  812    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  67.3 
 
 
638 aa  813    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  59 
 
 
807 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  60.83 
 
 
794 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  58.66 
 
 
805 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  55.48 
 
 
805 aa  657    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  65.94 
 
 
641 aa  847    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.58 
 
 
633 aa  838    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  60.07 
 
 
807 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  65.67 
 
 
651 aa  843    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  55.23 
 
 
644 aa  698    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  63.11 
 
 
652 aa  821    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  53.98 
 
 
674 aa  646    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  64.2 
 
 
655 aa  797    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  51.97 
 
 
661 aa  647    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  63.78 
 
 
672 aa  803    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  53.28 
 
 
687 aa  643    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  52.01 
 
 
649 aa  680    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  65.59 
 
 
650 aa  845    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  52.17 
 
 
696 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  62.2 
 
 
628 aa  835    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  58.27 
 
 
808 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  57.22 
 
 
812 aa  645    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  55.42 
 
 
636 aa  714    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  54.39 
 
 
666 aa  682    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  60.57 
 
 
802 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  58.74 
 
 
643 aa  749    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  58.25 
 
 
645 aa  700    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 
675 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  70.19 
 
 
640 aa  872    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  51.85 
 
 
675 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>