More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7332 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  100 
 
 
309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  77.44 
 
 
333 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  64.86 
 
 
323 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  69.03 
 
 
312 aa  391  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  67.43 
 
 
321 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  63.31 
 
 
318 aa  367  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  62.65 
 
 
328 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  66.67 
 
 
295 aa  358  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  65.07 
 
 
335 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  66.91 
 
 
329 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  62.5 
 
 
331 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  62.94 
 
 
324 aa  351  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  66.42 
 
 
392 aa  335  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  62.36 
 
 
379 aa  335  7.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  61.22 
 
 
314 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  61.87 
 
 
472 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  65.07 
 
 
529 aa  331  8e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  59.08 
 
 
330 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  59.08 
 
 
330 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  59.08 
 
 
330 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  55.16 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  56.84 
 
 
344 aa  325  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  58.72 
 
 
334 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  66.17 
 
 
383 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  65.93 
 
 
410 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  57.01 
 
 
331 aa  315  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  64.15 
 
 
377 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  55.43 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  55 
 
 
341 aa  312  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  61.94 
 
 
367 aa  305  9.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  49.86 
 
 
358 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  54.23 
 
 
398 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  61.42 
 
 
268 aa  288  8e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  49.32 
 
 
424 aa  281  7.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  59.58 
 
 
438 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  61.42 
 
 
624 aa  272  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  61.9 
 
 
394 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  51.48 
 
 
450 aa  261  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  46.91 
 
 
306 aa  242  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.41 
 
 
306 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.93 
 
 
319 aa  221  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  37.46 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  37.46 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  39.53 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.6 
 
 
283 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  39.53 
 
 
283 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  39.53 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  39.53 
 
 
283 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  40.95 
 
 
305 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  42.62 
 
 
298 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  39.87 
 
 
283 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  38.28 
 
 
289 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  39.2 
 
 
283 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  42.52 
 
 
292 aa  215  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  42.58 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  40.27 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.74 
 
 
272 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.02 
 
 
295 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  38.82 
 
 
286 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.19 
 
 
256 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41 
 
 
282 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.47 
 
 
283 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  40.8 
 
 
294 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.05 
 
 
285 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.92 
 
 
287 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  43.96 
 
 
304 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  42.44 
 
 
294 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.06 
 
 
289 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  43.67 
 
 
297 aa  208  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.8 
 
 
295 aa  208  9e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  42.28 
 
 
293 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  38.16 
 
 
294 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  42.81 
 
 
293 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  42.81 
 
 
293 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39 
 
 
279 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  43.33 
 
 
296 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  43 
 
 
288 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.54 
 
 
307 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  41.39 
 
 
295 aa  205  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  43.46 
 
 
286 aa  205  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  36.03 
 
 
283 aa  205  8e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  39 
 
 
279 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  37.34 
 
 
302 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  38.16 
 
 
293 aa  203  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  41.46 
 
 
310 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  37.17 
 
 
299 aa  203  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  41.69 
 
 
301 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  41.1 
 
 
310 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  35.45 
 
 
281 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  45.61 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40.32 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  41.39 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  41.47 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  42.86 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  41.72 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  39.15 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  38.98 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  39.15 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  37.54 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.55 
 
 
281 aa  199  5e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>