More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7325 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
730 aa  1439    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  66.41 
 
 
679 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 
498 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  36.77 
 
 
503 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
556 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
666 aa  105  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 
535 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  31.89 
 
 
622 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  34.63 
 
 
596 aa  101  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  34.53 
 
 
505 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  34.27 
 
 
532 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
624 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
624 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
624 aa  98.2  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
763 aa  97.4  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.84 
 
 
625 aa  95.1  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 
646 aa  94.7  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.51 
 
 
546 aa  94.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.79 
 
 
668 aa  94.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.69 
 
 
647 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  31.42 
 
 
625 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.03 
 
 
693 aa  93.2  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
502 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
612 aa  92.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  31.39 
 
 
625 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  31.83 
 
 
403 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.96 
 
 
676 aa  92  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 
559 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.99 
 
 
598 aa  90.9  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.43 
 
 
681 aa  90.9  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 
691 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  28.68 
 
 
736 aa  90.9  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
613 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.85 
 
 
668 aa  90.1  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  30.54 
 
 
593 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0943  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.22 
 
 
489 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal  0.789062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 
477 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  30.72 
 
 
623 aa  89.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
584 aa  89.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.74 
 
 
601 aa  89  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.61 
 
 
692 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  31.92 
 
 
582 aa  89  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.35 
 
 
627 aa  89  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  31.8 
 
 
509 aa  87.8  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
691 aa  87.8  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26 
 
 
579 aa  87.4  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  28.37 
 
 
626 aa  87.4  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  27.19 
 
 
618 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0363  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 
497 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  25.78 
 
 
621 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.61 
 
 
650 aa  87  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.61 
 
 
635 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.06 
 
 
681 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 
612 aa  85.9  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  30.51 
 
 
758 aa  85.1  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.75 
 
 
700 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
538 aa  84.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.4 
 
 
747 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.34 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 
368 aa  84  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 
398 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
470 aa  83.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
625 aa  83.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
700 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.21 
 
 
603 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
518 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 
487 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.15 
 
 
613 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 
985 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  31.89 
 
 
1217 aa  82.4  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 
691 aa  82  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
445 aa  82  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
533 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
581 aa  81.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
580 aa  80.9  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.41 
 
 
602 aa  80.9  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.18 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23 
 
 
652 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
569 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25.29 
 
 
614 aa  80.5  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  28.52 
 
 
597 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  29.36 
 
 
477 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
503 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
723 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
562 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.68 
 
 
662 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.77 
 
 
668 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.46 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
503 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
615 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
525 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.28 
 
 
662 aa  79.3  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.8 
 
 
499 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28 
 
 
594 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
568 aa  79.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>