263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7317 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  85.57 
 
 		 272 aa  307  9e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  66.29 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  62.56 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  65.19 
 
 		 212 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  68.29 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  58.6 
 
 		 227 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  61.05 
 
 		 201 aa  215  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  61.36 
 
 		 212 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  60.56 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  56.25 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  54.86 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  55.23 
 
 		 203 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  51.08 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  58.66 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  56 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  60 
 
 		 181 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  57.07 
 
 		 198 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  54.14 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  49.09 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 181 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  55.37 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  50.59 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 181 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 181 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 181 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 187 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  53.76 
 
 		 199 aa  141  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.95 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  28.99 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  41.84 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  27.91 
 
 		 165 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  26.04 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  26.04 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  26.04 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  27.22 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  26.04 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  26.04 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  30.81 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  37.01 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  40.21 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  29.71 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 114 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  32.37 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 108 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  38.82 
 
 		 110 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 106 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  31.91 
 
 		 103 aa  52.4  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  38.82 
 
 		 110 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 127 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 118 aa  52.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 110 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 110 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 114 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  37.65 
 
 		 110 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 110 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 111 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 110 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  36.47 
 
 		 110 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 121 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  31.67 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 116 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  40.24 
 
 		 132 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 109 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 114 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.01 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 104 aa  48.9  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  33.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 118 aa  48.9  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 122 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 102 aa  48.5  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>